208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0200 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0200  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000191145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  43.15 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0201  type IV pilin-related protein  42.28 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225415  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1204  hypothetical protein  34.68 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00605175  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1500  hypothetical protein  37.04 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0536  hypothetical protein  47.37 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  25.78 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1548  type IV pilin-related protein  35.96 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000491286  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.57 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  21.97 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  24.07 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  24.55 
 
 		 184 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  23.97 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  32.5 
 
 		 325 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  37.68 
 
 		 326 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  29.35 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  22.14 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  23.71 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  33.78 
 
 		 324 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  35.38 
 
 		 338 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  23.08 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  29.31 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  39.62 
 
 		 323 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  29.03 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  29.35 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  37.93 
 
 		 330 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  22.31 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  26.88 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  37.74 
 
 		 323 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  36.84 
 
 		 349 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  22.31 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  33.33 
 
 		 313 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.77 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  26.37 
 
 		 126 aa  47.4  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  41.51 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  27.17 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  28.72 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.89 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  28.41 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  27 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  39.62 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.62 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1809  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  24.65 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  24.27 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  23.81 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  28.3 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  24.27 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  19.85 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  23.81 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  34.43 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.34 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  35.85 
 
 		 362 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  23.73 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  38.46 
 
 		 348 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  35.59 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  21.54 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  27.47 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  25.27 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  25.23 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  40.38 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  25.56 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  23.91 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  39.62 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.04 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  34.38 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  21.49 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  21.49 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  44.23 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  26.26 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  23.58 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  28.3 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  37.25 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  24.27 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  22.12 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.04 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  23.53 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  26.09 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  25 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  26.09 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 		 139 aa  43.9  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  41.18 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  41.18 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  41.67 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  25.51 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  32.73 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.77 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  30.77 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  41.18 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  32.73 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  23.77 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  23.53 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  25 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.62 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.55 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  38.89 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.7 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>