165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4032 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4032  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  327  6e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4590  transcriptional regulator, MarR family  67.55 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2571  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  51.9 
 
 		 314 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.808395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.02 
 
 		 316 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.24 
 
 		 318 aa  105  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6080  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.54 
 
 		 319 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  29.22 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4320  MarR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 345 aa  91.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.06 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  24.18 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 		 327 aa  64.3  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 323 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6449  transcriptional regulator, MarR family  23.28 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2355  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  29.79 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  25.89 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  35.11 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  32.18 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  27.12 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  26.04 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  26.96 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  29.36 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  28 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 		 180 aa  44.7  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  23.62 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 151 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  32.93 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  30.95 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4357  transcriptional regulator, MarR family  23.01 
 
 		 188 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  24.55 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 170 aa  44.3  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1457  transcriptional regulator Hpr  28.69 
 
 		 205 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 155 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 151 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  23.46 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0418  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000420026  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  30.12 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  30.12 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  26.04 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  23.4 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.12 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4527  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>