244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1427 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 371 aa  766    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  70.49 
 
 		 370 aa  546  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  71.04 
 
 		 372 aa  542  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  56 
 
 		 367 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  54.3 
 
 		 376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  53.23 
 
 		 368 aa  391  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  50.27 
 
 		 378 aa  364  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  48.54 
 
 		 377 aa  357  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  45.82 
 
 		 370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  44.15 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  37.43 
 
 		 384 aa  248  8e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  35.81 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  36.05 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  35.22 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  32.97 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  37.09 
 
 		 389 aa  235  8e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  34.59 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  34.86 
 
 		 372 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 		 380 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  35.17 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  36.15 
 
 		 387 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 382 aa  223  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 		 379 aa  222  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  34.56 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 375 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  34.7 
 
 		 388 aa  216  7e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 375 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  31.75 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  35.37 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  34.7 
 
 		 376 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  34.22 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 380 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  32.34 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  33.87 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  33.7 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  36.2 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  33.72 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  32.54 
 
 		 383 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  35.98 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  34.88 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  32.54 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 376 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  32.04 
 
 		 384 aa  206  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  35 
 
 		 376 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  35.71 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  34.71 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  34.83 
 
 		 392 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  35.01 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  32.87 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  35.19 
 
 		 385 aa  203  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  34.22 
 
 		 380 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3422  lipid-A-disaccharide synthase  33.69 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00923603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1026  lipid-A-disaccharide synthase  33.69 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  32.8 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  36.83 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  30.73 
 
 		 384 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1079  lipid-A-disaccharide synthase  33.69 
 
 		 394 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  30.91 
 
 		 379 aa  199  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  34.99 
 
 		 398 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  36.51 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  34.66 
 
 		 398 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  34.66 
 
 		 392 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  31.83 
 
 		 392 aa  199  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  34.01 
 
 		 378 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  34.3 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  34.02 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  32.98 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  31.56 
 
 		 376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  34.39 
 
 		 398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  34.19 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  33.72 
 
 		 378 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  31.48 
 
 		 382 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  34.02 
 
 		 385 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  33.64 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  37.17 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  33.43 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  33.84 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  33.84 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00179  hypothetical protein  33.84 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000149064  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0175  lipid-A-disaccharide synthase  34.43 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00130827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  33.84 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  33.84 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0193  lipid-A-disaccharide synthase  34.43 
 
 		 382 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000445848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3478  lipid-A-disaccharide synthase  33.84 
 
 		 382 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  normal  0.0362862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0192  lipid-A-disaccharide synthase  33.84 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.103812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  34.69 
 
 		 380 aa  189  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  32.99 
 
 		 388 aa  189  8e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  34.55 
 
 		 379 aa  189  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  32.49 
 
 		 382 aa  189  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>