More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1362 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 228 aa  465  9.999999999999999e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  44.09 
 
 		 278 aa  194  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  45.07 
 
 		 275 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  43.52 
 
 		 265 aa  191  6e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  44.13 
 
 		 275 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  43.46 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  42.27 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  42.47 
 
 		 246 aa  189  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  42.01 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  40.18 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  40.64 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  39.27 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  42.01 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  41.55 
 
 		 242 aa  181  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1625  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  41.55 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  40.64 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  41.1 
 
 		 248 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  38.99 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  36.87 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  38.18 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  40.55 
 
 		 248 aa  174  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  39.25 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  40.27 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  38.32 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  39.35 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  39.35 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  38.36 
 
 		 243 aa  168  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 245 aa  167  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  36.82 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  35.53 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  38.36 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  37.83 
 
 		 272 aa  165  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  37.96 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  38.99 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  39.04 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  39.01 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  37.56 
 
 		 253 aa  162  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  37.09 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  36.99 
 
 		 239 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  35.48 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  39.17 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 226 aa  154  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  36.28 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  39.27 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  32.89 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  30.8 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  31.96 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  33.78 
 
 		 233 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  32.39 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  37.08 
 
 		 209 aa  134  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  35.59 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  35.03 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  32.73 
 
 		 232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  31.78 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  32.89 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  33.18 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  30.84 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  31.1 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  32.98 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  32.72 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  31.02 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  34.93 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  30.19 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  30.66 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  33.8 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  30 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  35.71 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  31.4 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  30.19 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  33.02 
 
 		 233 aa  118  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  30.22 
 
 		 227 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  29.86 
 
 		 228 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  31.92 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  33.49 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  31.13 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  30.23 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  36.65 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  30.09 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  30.23 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  30.23 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  30.66 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  30.23 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  28.3 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  32.88 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  27.44 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  30.23 
 
 		 225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  33.7 
 
 		 196 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  29.3 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>