239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0196 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 247 aa  488  1e-137  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  63.97 
 
 		 247 aa  315  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  32.78 
 
 		 244 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  30.12 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  28.51 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  34.86 
 
 		 339 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  30.85 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 231 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  34.86 
 
 		 360 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 		 375 aa  85.5  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 		 278 aa  85.5  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  32 
 
 		 360 aa  82  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.95 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  29.89 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  24.28 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  25.44 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.46 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.31 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 		 371 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  34.31 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 366 aa  58.5  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  24.43 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  28.65 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  26.32 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  34.93 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  26.52 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1451  hypothetical protein  28.97 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.245884  normal  0.0167299 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  27.69 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  38.46 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  26.94 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2959  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00595391  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  25.55 
 
 		 385 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  33.33 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  25.74 
 
 		 366 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  33.33 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  26.74 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  26.16 
 
 		 381 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  35.58 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  24.15 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.41 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 376 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 359 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 369 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 376 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 388 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 359 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 359 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  30.07 
 
 		 357 aa  52.8  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  26.81 
 
 		 387 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 		 375 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 378 aa  52.4  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  27.1 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  23.5 
 
 		 381 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  29.03 
 
 		 373 aa  52  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  23.11 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  34.38 
 
 		 289 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  26.61 
 
 		 376 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2470  ABC-2 type transporter  30.63 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218035  hitchhiker  0.00397591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  30.77 
 
 		 380 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  30.77 
 
 		 381 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  30.77 
 
 		 380 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  30.77 
 
 		 381 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  32.65 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 		 383 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 356 aa  50.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 376 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 383 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>