101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3068 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 247 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  96.55 
 
 		 194 aa  289  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  95.86 
 
 		 194 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  97.89 
 
 		 193 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  93.79 
 
 		 194 aa  280  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  94.41 
 
 		 194 aa  277  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  95.07 
 
 		 191 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  94.37 
 
 		 191 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  93.66 
 
 		 191 aa  272  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  93.66 
 
 		 191 aa  272  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  86.86 
 
 		 138 aa  251  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  79.14 
 
 		 190 aa  234  9e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2091  terminase GpA  79.71 
 
 		 641 aa  218  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11571  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10036  DNA packaging protein  79.71 
 
 		 641 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.722543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00731  hypothetical protein  79.71 
 
 		 641 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.634997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0832  phage terminase large subunit (GpA)  100 
 
 		 529 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.325192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1620  phage terminase large subunit  78.99 
 
 		 641 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047658 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1783  phage terminase large subunit  74.63 
 
 		 641 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  61.27 
 
 		 189 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  61.76 
 
 		 202 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  61.27 
 
 		 189 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  57.82 
 
 		 193 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  57.82 
 
 		 193 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2042  terminase GpA  63.24 
 
 		 641 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.324943  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  60.77 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  59.03 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1286  phage terminase large subunit (GpA)  53.79 
 
 		 642 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  54.17 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1454  phage terminase large subunit (GpA)  55.56 
 
 		 642 aa  132  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2815  phage terminase large subunit  52.38 
 
 		 643 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1675  phage terminase GpA  54.37 
 
 		 660 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3601  phage terminase GpA  55.34 
 
 		 665 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0753  phage terminase GpA  55.34 
 
 		 665 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0784  phage terminase GpA  55.34 
 
 		 665 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0205779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0780  terminase GpA  55.34 
 
 		 665 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.366774 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  36.51 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  59.41 
 
 		 442 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  41.35 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  82.54 
 
 		 89 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  35.37 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  38.46 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  83.33 
 
 		 89 aa  99.8  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3252  phage terminase GpA  57.33 
 
 		 634 aa  97.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  81.67 
 
 		 88 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  36.9 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  35.97 
 
 		 198 aa  96.3  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  39.29 
 
 		 203 aa  95.9  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  31.64 
 
 		 208 aa  95.1  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  37.06 
 
 		 200 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  32.75 
 
 		 200 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  35.66 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  35.66 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  34.27 
 
 		 200 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2230  phage terminase large subunit (GpA)  42.16 
 
 		 654 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  35.86 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  40.7 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  78.43 
 
 		 82 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4687  terminase GpA  44.19 
 
 		 698 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  39.68 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  51.56 
 
 		 170 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  45.45 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  55.38 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  60 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01356  hypothetical protein  91.67 
 
 		 36 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1042  Phage terminase GpA  36 
 
 		 665 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0571086  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  35.21 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  33.04 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  41.25 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  45.83 
 
 		 189 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  51.52 
 
 		 142 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  43.75 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2514  terminase GpA  37.97 
 
 		 604 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  47.69 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01978  hypothetical protein  37.84 
 
 		 635 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  34.44 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  48.53 
 
 		 135 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  31.34 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1636  tail fiber assembly protein, truncation  89.66 
 
 		 30 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269715  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  34.07 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0131  phage terminase GpA  34.83 
 
 		 592 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  47.37 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  62.16 
 
 		 47 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  46.55 
 
 		 92 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1779  phage terminase GpA  32 
 
 		 593 aa  52.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  33.68 
 
 		 114 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  35.62 
 
 		 1179 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  47.62 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  34.72 
 
 		 145 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2392  phage terminase GpA  32.47 
 
 		 587 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  47.46 
 
 		 139 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  31.11 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2309  phage terminase GpA  32.1 
 
 		 605 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1203  phage terminase GpA  38.67 
 
 		 614 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  31.16 
 
 		 292 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0627  hypothetical protein  37.5 
 
 		 116 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0684  tail fiber assembly protein  35 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5072  tail fiber assembly protein  35 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4023  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 131 aa  42.4  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0853  bacteriophage-like protein  32.1 
 
 		 660 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0455431 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>