More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2548 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2548  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
861 aa  1745    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  65.12 
 
 
826 aa  985    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.74 
 
 
760 aa  748    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2710  multi-sensor signal transduction histidine kinase  71.66 
 
 
756 aa  1071    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.438958  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
683 aa  276  9e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2370  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
672 aa  272  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
686 aa  271  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
671 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.918325 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
702 aa  264  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4833  sensory box histidine kinase  30.33 
 
 
899 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4373  PAS  33.17 
 
 
907 aa  193  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323082  normal  0.21328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2152  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
834 aa  192  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.116633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
682 aa  189  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0714  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
744 aa  188  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
921 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
936 aa  185  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 
804 aa  184  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  26.57 
 
 
1379 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  28.55 
 
 
917 aa  183  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
1076 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
881 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
1053 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  32.02 
 
 
1061 aa  180  8e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
671 aa  178  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.156465 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.98 
 
 
1105 aa  177  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
676 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0906179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 
707 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
676 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0701  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
540 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
652 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
641 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
845 aa  175  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2003  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
653 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.977312  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
1089 aa  175  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
630 aa  174  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.04 
 
 
1255 aa  174  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0050  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
871 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0971682  decreased coverage  0.000571287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4499  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
674 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278807  normal  0.486911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
607 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.65 
 
 
833 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
970 aa  172  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
654 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 
1509 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.34 
 
 
819 aa  171  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3022  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
1101 aa  170  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 
953 aa  171  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 
695 aa  170  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 
850 aa  171  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0957  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
676 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4089  PAS  30.88 
 
 
678 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.465781  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 
819 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13390  Sensory histidine protein kinase  30.32 
 
 
671 aa  169  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318892  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2828  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
584 aa  169  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.14 
 
 
1050 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1651  PAS sensor protein  31 
 
 
895 aa  168  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
557 aa  168  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0835  histidine kinase  33.25 
 
 
418 aa  167  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.882013  normal  0.0872609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
551 aa  167  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 
588 aa  167  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 
673 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
809 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0558  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 
763 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.043921  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  30.22 
 
 
1062 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 
801 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2283  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
643 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 
677 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2249  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.18 
 
 
771 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 
850 aa  165  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
560 aa  165  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  30.23 
 
 
1112 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
406 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4969  putative two-component sensor  28.31 
 
 
698 aa  164  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 
1418 aa  164  9e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4395  sensory box histidine kinase  29.66 
 
 
678 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2564  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
559 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382353  hitchhiker  0.0000221302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 
844 aa  163  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4860  sensory box histidine kinase  34.07 
 
 
923 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4423  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
678 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 
662 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
848 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57170  putative two-component sensor  28.77 
 
 
698 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
771 aa  163  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
557 aa  162  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
885 aa  161  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3096  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
659 aa  161  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
576 aa  161  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55780  putative two-component sensor  33.74 
 
 
922 aa  161  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  27.98 
 
 
812 aa  161  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
614 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
681 aa  160  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
714 aa  159  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 
642 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0622  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
753 aa  159  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 
1134 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.02 
 
 
1193 aa  158  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3375  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 
714 aa  158  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
544 aa  158  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 
642 aa  157  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
441 aa  157  8e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>