More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1517 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 372 aa  738    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 234 aa  185  9e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 220 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 227 aa  152  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 245 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 213 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 219 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 218 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  27.85 
 
 		 219 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 244 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  29.06 
 
 		 227 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 213 aa  89.4  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4065  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 199 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 220 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  37.61 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  48.08 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 239 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  47.76 
 
 		 214 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 213 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 212 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 212 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 212 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 224 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 204 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 247 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  44.78 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  54.72 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  44.78 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 225 aa  57  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  34.35 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  27.88 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 235 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  47.17 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  53.57 
 
 		 233 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 317 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  33.77 
 
 		 241 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 233 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 235 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 235 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  53.57 
 
 		 233 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 208 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 216 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 242 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  46.15 
 
 		 236 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 199 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 219 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3370  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 228 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0063882  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  46.15 
 
 		 236 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>