135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1133 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 342 aa  706    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  33.43 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2623  hypothetical protein  29.97 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1520  carbamoyl phosphate synthase-like protein  32.86 
 
 		 327 aa  155  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0533  carbamoyl phosphate synthase-like protein  29.61 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  27.36 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  28.57 
 
 		 321 aa  113  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 		 677 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  27.52 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3253  hypothetical protein  45.61 
 
 		 132 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  25.9 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.54 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  24.16 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2522  carbamoyl phosphate synthase-like protein  28.35 
 
 		 322 aa  89.4  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000809265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  29.39 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  22.77 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  23.32 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  25 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.08 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  25 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  22.22 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12823  carbamoyl-phosphate synthase, large (or ammonia) subunit (carB)  22.55 
 
 		 950 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.188852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  24.51 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0836  protein of unknown function DUF201  20.06 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.532579  normal  0.0458825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  23.66 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  24.54 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0099  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.58 
 
 		 951 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.217171  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3278  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.57 
 
 		 937 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0124  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.38 
 
 		 938 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  27.42 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0283  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.57 
 
 		 1053 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.85267 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  23.3 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3820  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.3 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.937743  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.4 
 
 		 950 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.964164  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  23.46 
 
 		 430 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  23.91 
 
 		 484 aa  54.3  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  22.96 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  22.94 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1562  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.12 
 
 		 1077 aa  53.5  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0554  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  22.58 
 
 		 528 aa  53.1  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  21.67 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  22.08 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  21.67 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  21.67 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0925  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.98 
 
 		 939 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.49458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0111  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.4 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  21.67 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0711  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.51 
 
 		 1097 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2876  hypothetical protein  21.84 
 
 		 734 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4658  hypothetical protein  24.21 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.601408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2456  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.54 
 
 		 1096 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2313  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.71 
 
 		 1079 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.417995  normal  0.014378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  22.83 
 
 		 356 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1868  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.63 
 
 		 1067 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0834  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.04 
 
 		 1053 aa  49.3  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.249678 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0635  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.04 
 
 		 1076 aa  48.9  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0189  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.24 
 
 		 1085 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0662  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.62 
 
 		 1072 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.04 
 
 		 1040 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2476  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.43 
 
 		 947 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0897  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.14 
 
 		 1076 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.641004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.65 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1990  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.56 
 
 		 1046 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.950925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0098  protein of unknown function DUF201  20.71 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6289  hypothetical protein  22.22 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.34 
 
 		 1496 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02243  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.9 
 
 		 1073 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0975  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  21.6 
 
 		 1098 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0977  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.08 
 
 		 1072 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2232  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.58 
 
 		 1079 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6239  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.5 
 
 		 958 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.77 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.96 
 
 		 1082 aa  47  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.827795  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1935  carbamoyl phosphate synthase-like protein  21.68 
 
 		 324 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.02 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10451  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.2 
 
 		 1098 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1042  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.32 
 
 		 1060 aa  46.6  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0008  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.23 
 
 		 1080 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  25.98 
 
 		 894 aa  46.2  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0990  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.21 
 
 		 1056 aa  46.2  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.587496  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0341  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.47 
 
 		 1081 aa  46.2  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.756805  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  25.73 
 
 		 896 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0775  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.41 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.486774  normal  0.246438 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  22.17 
 
 		 914 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.14 
 
 		 1064 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.04 
 
 		 1062 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1254  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.22 
 
 		 1074 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.179154  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  24.47 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  22.07 
 
 		 900 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0911  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.82 
 
 		 1081 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2319  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.34 
 
 		 1056 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0115  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.29 
 
 		 1056 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0222  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.11 
 
 		 1073 aa  44.7  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.256001  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0378  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.43 
 
 		 1076 aa  45.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.546328  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3018  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.23 
 
 		 1074 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  25.94 
 
 		 924 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0661  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20 
 
 		 1066 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00149325  normal  0.138255 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5754  pyruvate carboxylase  26.49 
 
 		 1169 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0085  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.08 
 
 		 1056 aa  44.3  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00260745  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1302  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.81 
 
 		 1082 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>