More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1795 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  100 
 
 		 494 aa  1031    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  35.99 
 
 		 460 aa  179  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4638  beta-lactamase  32.77 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  33.64 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  31.98 
 
 		 359 aa  163  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1856  beta-lactamase  30.75 
 
 		 498 aa  161  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  32.74 
 
 		 359 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  30.36 
 
 		 352 aa  157  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  32.52 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  37.5 
 
 		 417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  28.53 
 
 		 491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.46 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  28.71 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  27.48 
 
 		 377 aa  143  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  27.48 
 
 		 377 aa  143  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0889352 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4682  beta-lactamase  27.27 
 
 		 377 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0089  beta-lactamase  28.25 
 
 		 409 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0743599 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0086  beta-lactamase  28.25 
 
 		 409 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.057609 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  26.91 
 
 		 377 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  26.63 
 
 		 377 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4394  beta-lactamase  26.63 
 
 		 377 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04022  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  26.63 
 
 		 377 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03984  hypothetical protein  26.63 
 
 		 377 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5668  beta-lactamase  26.35 
 
 		 377 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.106194 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  28.82 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0339  beta-lactamase  25.65 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000286576 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  27.66 
 
 		 505 aa  128  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  30.72 
 
 		 381 aa  126  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  28.05 
 
 		 485 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  29.39 
 
 		 380 aa  124  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3723  beta-lactamase  28.98 
 
 		 388 aa  123  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  27.95 
 
 		 405 aa  121  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  28.21 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  28.21 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  28.69 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  27.27 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  26.22 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  28.45 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5057  beta-lactamase  27.48 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0475851 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.83 
 
 		 559 aa  117  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  28.69 
 
 		 485 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  27.38 
 
 		 388 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.02 
 
 		 578 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  27.38 
 
 		 388 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  27.38 
 
 		 383 aa  117  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  28.69 
 
 		 485 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  28.69 
 
 		 485 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  29.18 
 
 		 485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  27.14 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1593  beta-lactamase  25.8 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.450806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  26.13 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  26.13 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  30.55 
 
 		 385 aa  115  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  30.55 
 
 		 385 aa  115  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  30.55 
 
 		 385 aa  115  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  30.55 
 
 		 385 aa  115  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1776  beta-lactamase  27.97 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  30.55 
 
 		 385 aa  115  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  30.55 
 
 		 385 aa  115  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  30.55 
 
 		 385 aa  115  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  30.55 
 
 		 385 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  30.55 
 
 		 385 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1480  beta-lactamase  27.59 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0394716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2266  beta-lactamase  25.53 
 
 		 394 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2273  beta-lactamase  27.14 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1758  beta-lactamase  27.01 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.858626 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  27.97 
 
 		 485 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  28.41 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  32.22 
 
 		 357 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.27 
 
 		 487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  30.4 
 
 		 342 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10790  beta-lactamase  28.53 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.36 
 
 		 489 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  30.63 
 
 		 362 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  28.45 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  27.73 
 
 		 498 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  27.25 
 
 		 720 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  26.54 
 
 		 389 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  30.13 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0411  beta-lactam binding protein AmpH  30.13 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0417  beta-lactam binding protein AmpH  30.13 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.144637 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  24.79 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  30.13 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2383  beta-lactamase  24.73 
 
 		 394 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283495  hitchhiker  0.000989813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0429  beta-lactam binding protein AmpH  30.13 
 
 		 385 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.524845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0984  beta-lactamase  28.12 
 
 		 397 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00291811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2079  beta-lactamase  25.2 
 
 		 394 aa  107  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.221207  hitchhiker  0.00000730378 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  25.29 
 
 		 650 aa  106  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3594  beta-lactamase  25.43 
 
 		 383 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.83 
 
 		 477 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  29.12 
 
 		 544 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  29.26 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  29.5 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2585  beta-lactamase  25.13 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2086  beta-lactamase  25.33 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3476  beta-lactamase  31.52 
 
 		 474 aa  104  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  28.9 
 
 		 616 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  24.65 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2905  beta-lactamase  23.65 
 
 		 380 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.746622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2876  beta-lactamase  23.18 
 
 		 380 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>