84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0594 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  63.53 
 
 		 506 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1050    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  41.27 
 
 		 528 aa  330  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  38.67 
 
 		 525 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  38.06 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  38.01 
 
 		 511 aa  302  8.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  38.14 
 
 		 540 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  37.13 
 
 		 520 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  38.39 
 
 		 524 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  34.72 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  37.04 
 
 		 529 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  33.59 
 
 		 514 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  34.09 
 
 		 498 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  33.4 
 
 		 513 aa  233  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  31.96 
 
 		 533 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  32.33 
 
 		 509 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  32.37 
 
 		 505 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  31.51 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  30.09 
 
 		 498 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  30.94 
 
 		 508 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  29.5 
 
 		 482 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  29.46 
 
 		 476 aa  169  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  27.83 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  29.94 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  26.89 
 
 		 500 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  30.38 
 
 		 492 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  28.27 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  30.02 
 
 		 479 aa  143  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  28.55 
 
 		 486 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  27.59 
 
 		 489 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  28.36 
 
 		 487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  26.26 
 
 		 515 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  29.55 
 
 		 504 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  29.31 
 
 		 543 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  25.97 
 
 		 522 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  26.33 
 
 		 515 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  26.32 
 
 		 489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  26.19 
 
 		 552 aa  130  6e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  28.62 
 
 		 517 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  28.23 
 
 		 514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  26.89 
 
 		 518 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  28.06 
 
 		 526 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  25.28 
 
 		 488 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  26.11 
 
 		 463 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  28.36 
 
 		 525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  26.79 
 
 		 532 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  27.05 
 
 		 487 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  26.39 
 
 		 499 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  24.69 
 
 		 536 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  28.38 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  26.45 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  26.51 
 
 		 526 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  25.36 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  29.38 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  26.31 
 
 		 541 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  25.47 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  26.11 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  23.41 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  27.08 
 
 		 530 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  27.83 
 
 		 484 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  26.35 
 
 		 525 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  27.13 
 
 		 538 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  27.02 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  27.37 
 
 		 533 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  26.97 
 
 		 532 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  25.95 
 
 		 536 aa  94.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  25.74 
 
 		 480 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  29.81 
 
 		 547 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  25.15 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  25 
 
 		 534 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  28.01 
 
 		 578 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  23.75 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  27.21 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  27.71 
 
 		 570 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  28.69 
 
 		 630 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  26.02 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  24.81 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  25.05 
 
 		 474 aa  67  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  24.17 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  23.4 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  24.7 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  23.37 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  23.42 
 
 		 539 aa  53.5  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>