More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0970 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  85.24 
 
 		 481 aa  852    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 479 aa  993    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  90.19 
 
 		 479 aa  914    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  38.03 
 
 		 277 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.47 
 
 		 251 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  34.84 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  35.92 
 
 		 221 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 301 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  38.03 
 
 		 204 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  37.06 
 
 		 373 aa  130  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 		 247 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 		 240 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 		 275 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 		 275 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 		 275 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 		 275 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.99 
 
 		 275 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.67 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 		 275 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.67 
 
 		 275 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 		 256 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 		 302 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 		 247 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.19 
 
 		 264 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  34.4 
 
 		 522 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  31.68 
 
 		 276 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 		 229 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 		 232 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  32.48 
 
 		 261 aa  120  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  33.83 
 
 		 413 aa  120  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  34.3 
 
 		 222 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.65 
 
 		 241 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  37.09 
 
 		 368 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  32.61 
 
 		 1099 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  32.1 
 
 		 244 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 372 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  34.93 
 
 		 244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  32.24 
 
 		 224 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  32.08 
 
 		 270 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  36.41 
 
 		 235 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 241 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0292  polysaccharide deacetylase  35.84 
 
 		 317 aa  113  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 213 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 213 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 213 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  32.65 
 
 		 272 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  32.57 
 
 		 1154 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 241 aa  113  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  32.69 
 
 		 244 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 213 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  33.67 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 220 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  32.21 
 
 		 241 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 217 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 752 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  31.47 
 
 		 258 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  37.02 
 
 		 300 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 1120 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 283 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3501  putative polysaccharide deacetylase  35.06 
 
 		 234 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 281 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  37.2 
 
 		 238 aa  110  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 		 236 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  35.82 
 
 		 387 aa  110  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1842  putative polysaccharide deacetylase  33.77 
 
 		 234 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 		 285 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1924  polysaccharide deacetylase, putative  32.62 
 
 		 234 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.267114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 258 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  29.36 
 
 		 283 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 243 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  33.97 
 
 		 321 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  30.74 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  30.32 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  33.84 
 
 		 229 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.86 
 
 		 1115 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  31.39 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1959  putative polysaccharide deacetylase  34.27 
 
 		 234 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 		 241 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  31.17 
 
 		 288 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 233 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0336  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1683  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  33.05 
 
 		 234 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.381461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  30.85 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  31.9 
 
 		 872 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  34.62 
 
 		 267 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  27.97 
 
 		 258 aa  107  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 291 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1696  polysaccharide deacetylase  32.9 
 
 		 234 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.847499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1658  polysaccharide deacetylase; chitooligosaccharide deacetylase  32.62 
 
 		 234 aa  106  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 1115 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  33.17 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  32.38 
 
 		 1115 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  32.38 
 
 		 1119 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.38 
 
 		 1115 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  33.49 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>