More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1331 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  100 
 
 		 596 aa  1194    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  38.57 
 
 		 611 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  34.64 
 
 		 584 aa  332  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  33.45 
 
 		 593 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  32.59 
 
 		 595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  33.17 
 
 		 597 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.91 
 
 		 573 aa  304  4.0000000000000003e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  31.8 
 
 		 592 aa  300  4e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.09 
 
 		 581 aa  295  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  31.4 
 
 		 604 aa  296  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  34.56 
 
 		 1138 aa  294  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  32.46 
 
 		 619 aa  294  4e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.38 
 
 		 1091 aa  293  8e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.58 
 
 		 597 aa  292  9e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  32.32 
 
 		 599 aa  291  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.22 
 
 		 618 aa  290  6e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  32.68 
 
 		 609 aa  288  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  32.75 
 
 		 590 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  33.45 
 
 		 598 aa  283  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  33.01 
 
 		 618 aa  283  8.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  34.68 
 
 		 600 aa  283  9e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  31.15 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.13 
 
 		 589 aa  280  4e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.32 
 
 		 576 aa  279  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  31.23 
 
 		 611 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  33.92 
 
 		 606 aa  277  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  34.64 
 
 		 600 aa  276  6e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  37.04 
 
 		 565 aa  276  9e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  28.55 
 
 		 587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  28.55 
 
 		 587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.8 
 
 		 593 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  32.66 
 
 		 599 aa  272  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  32.2 
 
 		 588 aa  270  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.99 
 
 		 590 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  32.03 
 
 		 609 aa  267  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  28.82 
 
 		 590 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  32.1 
 
 		 580 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  30.12 
 
 		 579 aa  266  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  31.44 
 
 		 593 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  30.55 
 
 		 596 aa  263  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.34 
 
 		 578 aa  262  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.16 
 
 		 580 aa  261  4e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  29.4 
 
 		 602 aa  259  7e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  33.83 
 
 		 608 aa  259  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 579 aa  257  4e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  30.23 
 
 		 577 aa  257  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  30.23 
 
 		 577 aa  257  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  33.97 
 
 		 576 aa  256  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  31.71 
 
 		 611 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  33.63 
 
 		 577 aa  254  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  30.2 
 
 		 608 aa  253  8.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.13 
 
 		 627 aa  252  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.99 
 
 		 595 aa  250  4e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  32.36 
 
 		 600 aa  250  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.36 
 
 		 603 aa  250  6e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  30.47 
 
 		 581 aa  250  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  32.57 
 
 		 1228 aa  250  7e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  30.49 
 
 		 579 aa  249  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  31.01 
 
 		 606 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0675  ABC transporter related protein  26.66 
 
 		 584 aa  248  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.02 
 
 		 583 aa  246  6.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  33.79 
 
 		 603 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  31.69 
 
 		 588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  34.32 
 
 		 596 aa  244  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.03 
 
 		 596 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1642  ABC transporter, transmembrane region, type 1  32.93 
 
 		 573 aa  244  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.45 
 
 		 588 aa  243  6e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  36.08 
 
 		 596 aa  243  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  30.69 
 
 		 587 aa  243  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  33.57 
 
 		 578 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54980  poossible ABC-type transporter protein  29.93 
 
 		 584 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875214  unclonable  5.28069e-21 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  27.89 
 
 		 578 aa  242  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.29 
 
 		 573 aa  242  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  27.89 
 
 		 578 aa  242  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.23 
 
 		 579 aa  242  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.98 
 
 		 584 aa  242  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  31.78 
 
 		 605 aa  241  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.1 
 
 		 581 aa  240  5e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  35.31 
 
 		 583 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.15 
 
 		 583 aa  238  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  29.7 
 
 		 577 aa  239  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  28.03 
 
 		 573 aa  238  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  32.02 
 
 		 573 aa  236  6e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  36.24 
 
 		 593 aa  236  6e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2098  ABC transporter related  34.76 
 
 		 609 aa  236  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  28.2 
 
 		 573 aa  236  9e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.3 
 
 		 585 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  28.3 
 
 		 585 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.34 
 
 		 577 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54970  ABC transporter  34.21 
 
 		 585 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479716  unclonable  4.5900199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41 
 
 		 582 aa  234  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  31.81 
 
 		 619 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  33.89 
 
 		 642 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.1 
 
 		 571 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  31.84 
 
 		 603 aa  234  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  31.76 
 
 		 579 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  35.4 
 
 		 606 aa  233  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0881  ABC transporter component  32.11 
 
 		 589 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  31.79 
 
 		 579 aa  233  8.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  29.62 
 
 		 592 aa  233  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>