More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3740 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3740  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 403 aa  829    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0664  putative response regulator protein  31.88 
 
 		 508 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3322  transcriptional regulator, LuxR family  35.23 
 
 		 375 aa  206  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.304808  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0929  transcriptional regulator, LuxR family  48.99 
 
 		 498 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.661011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2244  transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1231  transcriptional regulator, LuxR family  37.67 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0692085  normal  0.545036 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2173  LuxR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 269 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0038  transcriptional regulator, LuxR family  27.76 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1366  probable regulatory protein, LuxR domain protein  29.14 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0947  two component LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00385235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1031  transcriptional regulator, LuxR family  27.1 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 231 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 1255 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4664  two component LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 230 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 213 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15001  response regulator  43.28 
 
 		 193 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.608527  normal  0.0430708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 217 aa  53.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5542  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 212 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.448293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 250 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 229 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 219 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 225 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 223 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0166  transcriptional regulator, LuxR family protein  31.1 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00243136  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.45 
 
 		 207 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1062  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 257 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 228 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 224 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2246  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0703025  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.98 
 
 		 224 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 219 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5287  transcriptional regulator, LuxR family  52.08 
 
 		 206 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  44.62 
 
 		 231 aa  50.4  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  51.02 
 
 		 937 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3239  two component LuxR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 274 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1943  two component LuxR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 214 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  36.07 
 
 		 914 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 215 aa  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 254 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 216 aa  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  50 
 
 		 216 aa  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2713  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 216 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 214 aa  49.7  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.140358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01821  LuxR family regulatory protein  42.62 
 
 		 92 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 214 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  50 
 
 		 218 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 220 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 228 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 215 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 217 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 		 398 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  35.78 
 
 		 217 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 215 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4639  two component LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84039  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 215 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 225 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 		 215 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0833  regulatory protein, LuxR  40.3 
 
 		 904 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5351  transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 229 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649636  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  47.27 
 
 		 212 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.94 
 
 		 214 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 212 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.64 
 
 		 931 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  42.03 
 
 		 229 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  35.35 
 
 		 900 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 208 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  42.47 
 
 		 220 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 956 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.01 
 
 		 224 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  33.01 
 
 		 224 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  33.01 
 
 		 224 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 246 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1884  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 219 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 217 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 214 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0970  two component LuxR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 209 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0307407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.02 
 
 		 219 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 220 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2048  transcriptional regulator, LuxR family  52.08 
 
 		 280 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  51.85 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  42.37 
 
 		 896 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34130  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.92 
 
 		 853 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 213 aa  47.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 208 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 209 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 217 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 213 aa  47.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000091  transcriptional regulatory protein UhpA  44.07 
 
 		 202 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136186  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  45.16 
 
 		 879 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 206 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.37 
 
 		 201 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3979  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 220 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4204  two component LuxR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 202 aa  47  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00789571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>