More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2362 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 413 aa  835    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  49.78 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  50.13 
 
 		 404 aa  364  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  34.77 
 
 		 389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  28.18 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  30.14 
 
 		 392 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  28.15 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  30.59 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  33.94 
 
 		 391 aa  136  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  28.66 
 
 		 387 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  29.14 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  29.58 
 
 		 406 aa  129  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.36 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  26.54 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.4 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  27.25 
 
 		 373 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  27.25 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  24.64 
 
 		 392 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  26.97 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  28.72 
 
 		 390 aa  110  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  29.21 
 
 		 400 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  27.74 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  27.05 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.09 
 
 		 382 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  26.41 
 
 		 430 aa  106  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  25.89 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  27.4 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  27.4 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  27.4 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  27.4 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  27.4 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  27.4 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  27.4 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  29.45 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  28.93 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  29.45 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.57 
 
 		 423 aa  103  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  27.15 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  25.77 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  28.11 
 
 		 537 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  27.21 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  26.71 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  28.03 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.27 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  26.46 
 
 		 439 aa  99.8  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  24.42 
 
 		 397 aa  99.4  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  25.91 
 
 		 397 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  24.86 
 
 		 417 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  25.73 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.89 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.45 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  26 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  24.44 
 
 		 400 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  26.55 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  26.53 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  26.83 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  26.74 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  26.96 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  26.96 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  26.96 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  26.22 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  27.94 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  26.53 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  21.38 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  27.93 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  27.44 
 
 		 419 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  23.43 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  24.91 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  26.28 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  25.48 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  26.37 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  21.91 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  26.2 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  26.2 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  24.92 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.15 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.08 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.57 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  23.01 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  23.01 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  23.03 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4866  response regulator receiver protein  25.08 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  25.88 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  25.98 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.14 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  23.77 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.78 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  24.24 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  24.91 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  25.16 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.55 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  24.29 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  25.44 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  22.64 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2161  pilus assembly protein CpaE  23.81 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  0.0348695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  22.07 
 
 		 580 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>