More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2356 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 453 aa  882    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  46.9 
 
 		 475 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  44.27 
 
 		 492 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 467 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 465 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  44.77 
 
 		 472 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  42.92 
 
 		 465 aa  336  5.999999999999999e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 456 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  42.79 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  41.37 
 
 		 466 aa  329  6e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 		 497 aa  329  6e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 487 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  41.96 
 
 		 461 aa  324  3e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.95 
 
 		 474 aa  320  3e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  41.59 
 
 		 465 aa  315  9e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  42.66 
 
 		 469 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  44.3 
 
 		 462 aa  313  5.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  38.65 
 
 		 453 aa  300  3e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  42.79 
 
 		 466 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 458 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 479 aa  272  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 462 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 446 aa  249  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 474 aa  227  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.1 
 
 		 474 aa  225  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.85 
 
 		 475 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.86 
 
 		 456 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 477 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.8 
 
 		 465 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 459 aa  203  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.16 
 
 		 483 aa  193  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.09 
 
 		 482 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.18 
 
 		 475 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 		 486 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.98 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.43 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.07 
 
 		 483 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 477 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.97 
 
 		 478 aa  177  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.37 
 
 		 500 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  28.87 
 
 		 462 aa  173  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.28 
 
 		 472 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.51 
 
 		 455 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.63 
 
 		 482 aa  172  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.97 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 475 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 455 aa  171  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 488 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 477 aa  170  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 455 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.34 
 
 		 482 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 416 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.95 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.67 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.7 
 
 		 510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.18 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  31.58 
 
 		 490 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 461 aa  164  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  31.46 
 
 		 473 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  31.5 
 
 		 457 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 459 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.32 
 
 		 476 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.38 
 
 		 474 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  30.83 
 
 		 464 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.65 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 478 aa  157  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  37.46 
 
 		 444 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 462 aa  156  7e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.91 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.92 
 
 		 521 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.75 
 
 		 504 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.33 
 
 		 514 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 491 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>