97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2115 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2115  Beta-lactamase  100 
 
 		 420 aa  847    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269149  normal  0.194976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4468  putative Beta-lactamase family protein  23.56 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3787  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.14 
 
 		 445 aa  97.4  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0617311  normal  0.585556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4946  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.42 
 
 		 444 aa  97.1  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  22.84 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  25.46 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3282  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.33 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.622718  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1411  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.6 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.8 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2098  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.68 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0338  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  20.37 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.691557  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2084  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.4 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113455  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.78 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2020  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.36 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1974  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.36 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624159  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1954  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.27 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1441  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.23 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793132  normal  0.012799 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.61 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1482  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.95 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0769543  normal  0.0469616 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  22.7 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1765  6-aminohexanoate-dimer hydrolase lipoprotein  23.55 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.431055  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2128  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.66 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2715  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.71 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2807  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.2 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0455053  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  23.53 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2876  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.24 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0655  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.9 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.7 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1945  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.17 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0642639  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.82 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.96 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3290  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.27 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.46 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  24.26 
 
 		 598 aa  66.6  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.05 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.98 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.2 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.2 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.96 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3014  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.01 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00694763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3316  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.8 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5283  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.93 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5936  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.07 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1793  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5145  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.47 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.6 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4421  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.17 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.74 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2479  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.16 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  24.77 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  27.48 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  22.98 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.44 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  21.3 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  25.11 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  23.08 
 
 		 530 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11737  hydrolase  22.94 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.19965e-18  normal  0.71078 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  22.34 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1669  beta-lactamase  23.73 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13265  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  20.54 
 
 		 395 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  24.88 
 
 		 486 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3884  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.41 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.383079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.25 
 
 		 476 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  26.52 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  27.95 
 
 		 371 aa  53.5  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3144  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.6 
 
 		 439 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  22.38 
 
 		 503 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  21.36 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  22.94 
 
 		 340 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  21.63 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.07 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  22.26 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  20.52 
 
 		 315 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  24.89 
 
 		 505 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  25.57 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  23.98 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  25.3 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  23.62 
 
 		 640 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  21.22 
 
 		 315 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  23.68 
 
 		 396 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  26.49 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  19.93 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  22.11 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  21.72 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  26.07 
 
 		 530 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  24.46 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  29 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  25.93 
 
 		 362 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  25.34 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  35.23 
 
 		 468 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  25.34 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  27.35 
 
 		 475 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  21.12 
 
 		 387 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  24.45 
 
 		 366 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  22.97 
 
 		 359 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  24 
 
 		 360 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2086  putative beta-lactamase  22.09 
 
 		 421 aa  43.1  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>