More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3734 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  55.42 
 
 		 262 aa  288  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  55.02 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  51.6 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 262 aa  208  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  44.66 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 283 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 259 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  43.1 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1420  AraC protein arabinose-binding/dimerization  44.62 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  39.34 
 
 		 281 aa  185  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  43.39 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  42.98 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  38.05 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  40.16 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  43.5 
 
 		 248 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  40.15 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  36.78 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  38.17 
 
 		 286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  41.32 
 
 		 260 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 247 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 292 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  36.84 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 272 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  36.32 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 287 aa  154  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 293 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 293 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  35.46 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  36.99 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 273 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  36.49 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  36.53 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>