201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2688 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  71.7 
 
 		 155 aa  233  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  64.33 
 
 		 162 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  63.06 
 
 		 162 aa  196  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  66.91 
 
 		 158 aa  191  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  59.28 
 
 		 167 aa  189  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  65.25 
 
 		 154 aa  180  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  62.79 
 
 		 156 aa  174  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  60 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  59.31 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  59.42 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  57.97 
 
 		 162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  58.99 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  54.94 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  55.47 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  52.94 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  52.94 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  48.24 
 
 		 195 aa  148  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  54.29 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  51.77 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  51.77 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  51.06 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  50.35 
 
 		 302 aa  137  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  47.65 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  44.44 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  55.75 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  48.48 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  47.83 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  42.07 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  47.2 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  46.34 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  40.71 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  41.73 
 
 		 328 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  47.57 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  39.46 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  41.14 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  41.91 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  41.54 
 
 		 160 aa  97.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  42.52 
 
 		 334 aa  96.3  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  40.65 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  42.52 
 
 		 351 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  38.61 
 
 		 179 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  38.1 
 
 		 320 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  39.69 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  41.91 
 
 		 342 aa  91.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  35.62 
 
 		 190 aa  91.3  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  39.74 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  34.59 
 
 		 307 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  41.12 
 
 		 337 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  40.14 
 
 		 142 aa  88.6  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  35.46 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  31.21 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  35.63 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  43.4 
 
 		 319 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  37.23 
 
 		 327 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  38.46 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  36.62 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  41.51 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  84  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  35.25 
 
 		 167 aa  84  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  32.88 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  34.04 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  44.44 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  32.89 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  35.77 
 
 		 323 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  37.38 
 
 		 338 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  32.39 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  39.07 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  33.91 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  35.25 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4042  hypothetical protein  37.82 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  31.93 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  36.22 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  37.3 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  37.88 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5007  protein of unknown function DUF461  37.84 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  33.12 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  38.24 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  34.06 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  42.45 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  32.59 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  38.32 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  35.85 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  35.77 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  32.46 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1251  hypothetical protein  36.64 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  34.23 
 
 		 365 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  38.1 
 
 		 357 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  41.18 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  34.29 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  33.57 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  32.87 
 
 		 324 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  34.38 
 
 		 227 aa  74.3  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  37.82 
 
 		 321 aa  73.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  36.36 
 
 		 357 aa  73.9  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  36.89 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  34.81 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19130  hypothetical protein  34.27 
 
 		 209 aa  72  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.128476  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  31.87 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>