137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1830 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 212 aa  410  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  56.94 
 
 		 227 aa  187  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  56.94 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  51.4 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  49.5 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  46 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  38.35 
 
 		 183 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  36.41 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  46.23 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  45.5 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  44.22 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  43.56 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  43.33 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  43.78 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  44.2 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  38.81 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  44.2 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  40.4 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  41.09 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  40.59 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  36.68 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  35.5 
 
 		 207 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  35.5 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  32.66 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  36.18 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  32.32 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  35.15 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  30.69 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  36.82 
 
 		 200 aa  88.2  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  31.41 
 
 		 243 aa  88.2  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  32.54 
 
 		 200 aa  88.2  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  32.83 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  31.84 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  37 
 
 		 241 aa  85.9  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  34.41 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  34.41 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  28.08 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  34.86 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  32.58 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  34.85 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  34.18 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  35.68 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  31.66 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  31.73 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  32.81 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  31.63 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  31.86 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  31.25 
 
 		 243 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  31.05 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  30.22 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  30.22 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  35.06 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  30.85 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  30.22 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  30.22 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  30.22 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  30.22 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  30.22 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  30.22 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  29.67 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  27.22 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  32.75 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  30.93 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  30.93 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  30.93 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  30.93 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  29.94 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  29.41 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  31.9 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  31.32 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  30.57 
 
 		 249 aa  64.7  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  30.57 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  30.57 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  29.38 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  29.9 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  29.9 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  29.38 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  29.89 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  29.38 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  34.22 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  31.96 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  30.29 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  29.71 
 
 		 254 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  28.65 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  29.71 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  28.81 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  28.8 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  32.39 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  31.05 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  32.64 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  27.53 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  26.97 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  30.3 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  23.6 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  28.93 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  32.94 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  26.37 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  31.07 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  32.2 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  25.26 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>