87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1737 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  695    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.99 
 
 		 356 aa  420  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  68.66 
 
 		 351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  59.54 
 
 		 353 aa  391  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  68.66 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.17 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  60.84 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.92 
 
 		 353 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  66.19 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  60.96 
 
 		 380 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  59.88 
 
 		 354 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.71 
 
 		 348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  58.51 
 
 		 396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  58.51 
 
 		 356 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  58.51 
 
 		 356 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  60.35 
 
 		 372 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  58.21 
 
 		 358 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  58.21 
 
 		 356 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  58.51 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  55.1 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  60.36 
 
 		 353 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.02 
 
 		 358 aa  326  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  65.91 
 
 		 352 aa  325  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  57.66 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  57.66 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.13 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  54.3 
 
 		 349 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  53.94 
 
 		 372 aa  288  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  51.14 
 
 		 372 aa  288  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  51.14 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  51.14 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  50.45 
 
 		 353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  52.06 
 
 		 350 aa  278  8e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  52.63 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  48.41 
 
 		 349 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.41 
 
 		 349 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  54.33 
 
 		 318 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  44.9 
 
 		 346 aa  245  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  39.08 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  41.11 
 
 		 344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  40.57 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  47.73 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.94 
 
 		 330 aa  212  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.02 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.79 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  38.35 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.85 
 
 		 323 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  41.58 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  32.03 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.2 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 		 351 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  35.21 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  32.1 
 
 		 293 aa  90.1  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  29.26 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.35 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  27.88 
 
 		 330 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  30.41 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  22.08 
 
 		 302 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  27.17 
 
 		 335 aa  49.7  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  47.69 
 
 		 92 aa  49.7  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.18 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  23.81 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2621  hypothetical protein  23.89 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  23.97 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.28 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  28.25 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 314 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 294 aa  46.2  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  24.54 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  23.81 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48084  predicted protein  25.41 
 
 		 538 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0292036  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  25.72 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  23.44 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0543  hypothetical protein  22.34 
 
 		 271 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.530705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  23.81 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  23.08 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  23.08 
 
 		 302 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  28.65 
 
 		 302 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  26.12 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  22.59 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1038  hypothetical protein  32.41 
 
 		 289 aa  42.7  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  24.6 
 
 		 310 aa  42.7  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26 
 
 		 311 aa  42.7  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>