More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0857 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0857  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 236 aa  470  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0165022  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0775  ABC transporter related  83.05 
 
 		 236 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  41.12 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  44.05 
 
 		 229 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  41.86 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  40.09 
 
 		 656 aa  168  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40 
 
 		 642 aa  168  7e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  39.3 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  41.03 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.66 
 
 		 656 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  42.18 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  41.26 
 
 		 565 aa  166  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.18 
 
 		 642 aa  167  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  40.74 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  38.99 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  42.06 
 
 		 241 aa  164  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  37.17 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  39.53 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  39.45 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  39.72 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  41.23 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  39.73 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  41.96 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  40.18 
 
 		 644 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.97 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.1 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  38.22 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  40.36 
 
 		 563 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  38.89 
 
 		 640 aa  160  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.82 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  39.29 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  38.42 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.82 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.19 
 
 		 665 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  39.91 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 649 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  38.18 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1310  ABC transporter related  42.25 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272111  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0562  ABC transporter related  40.19 
 
 		 665 aa  159  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  38.57 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  40.27 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  38.46 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  40.93 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  40.37 
 
 		 662 aa  159  5e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  40.09 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  40 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  38.81 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  39.81 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  41.28 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  38.32 
 
 		 269 aa  158  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  41.55 
 
 		 248 aa  158  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.73 
 
 		 664 aa  158  8e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.94 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0403  ABC transporter related  38.89 
 
 		 217 aa  158  9e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.784809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  42.41 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  41.96 
 
 		 650 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  38.03 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  39.01 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  40.43 
 
 		 654 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  40.18 
 
 		 648 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  40.64 
 
 		 664 aa  157  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  40.72 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  41 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  39.35 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26100  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.01 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.723812  normal  0.918688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  43.56 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  40.45 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5546  ABC transporter related  38.07 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  hitchhiker  0.00000572537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1795  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  39.17 
 
 		 656 aa  156  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  37.73 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  37.55 
 
 		 682 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  40.62 
 
 		 653 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  34.91 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  40.62 
 
 		 655 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  38.76 
 
 		 286 aa  155  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  40.45 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  37.9 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  38.36 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  41.54 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  39.45 
 
 		 643 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  39.01 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  38.91 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  37.12 
 
 		 667 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2085  ABC transporter related  43.32 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  39.01 
 
 		 668 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  37.12 
 
 		 667 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  37.12 
 
 		 682 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  39.53 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>