More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0775 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0775  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0857  ABC transporter, ATP-binding protein  83.05 
 
 		 236 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0165022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  42.79 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  39.91 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  41.12 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  43.18 
 
 		 563 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  43.26 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  40.18 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  43.06 
 
 		 565 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  44.1 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  41.59 
 
 		 668 aa  172  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  41.74 
 
 		 644 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  41.94 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  40.99 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.4 
 
 		 642 aa  167  9e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1310  ABC transporter related  44.86 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272111  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  42.01 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  40.91 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  40.91 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  40.64 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  39.3 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  39.53 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 221 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 643 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  41.07 
 
 		 656 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.07 
 
 		 656 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  40.65 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  42.41 
 
 		 649 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  40.47 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  39.27 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  40 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  38.29 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  41.05 
 
 		 248 aa  162  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.18 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  42.41 
 
 		 650 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  39.45 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.18 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.65 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  38.36 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  40.18 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.18 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  40.45 
 
 		 233 aa  161  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  41.74 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  39.25 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 230 aa  161  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  40.37 
 
 		 230 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  39.91 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  39.73 
 
 		 642 aa  161  9e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.44 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1377  ABC transporter related  40.19 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  38.79 
 
 		 648 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  38.79 
 
 		 648 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  39.53 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  41.04 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  40.93 
 
 		 217 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  42.21 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.23 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  41.67 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  38.84 
 
 		 667 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  38.84 
 
 		 667 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  41.67 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  37.55 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  40.19 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  40.28 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  40.74 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  39.72 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  42.2 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  40.44 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  38.33 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  39.29 
 
 		 682 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  40.64 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  43.55 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  40.57 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  36.2 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.24 
 
 		 664 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  39.37 
 
 		 664 aa  159  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.28 
 
 		 640 aa  159  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  40.19 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  40.09 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  38.81 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  38.89 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  42.08 
 
 		 662 aa  159  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  40.81 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  38.84 
 
 		 682 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  41.35 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  38.99 
 
 		 222 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  39.09 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  37.67 
 
 		 247 aa  158  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  39.73 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  37.9 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>