More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4388 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2569  riboflavin synthase subunit alpha  54.1 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  55.36 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  57.59 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  51.93 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  51.93 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  53.33 
 
 		 225 aa  224  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  53.54 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06371  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 		 220 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  46.4 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  46.4 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  42.34 
 
 		 217 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  42.34 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  44.64 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  44.84 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04391  riboflavin synthase subunit alpha  42.6 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  42.73 
 
 		 219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  38.14 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  42.04 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  43.23 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  42.15 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  39.46 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  39.56 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  42.41 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  41.33 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  40.53 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  38.6 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  42.22 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  41.15 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  41.85 
 
 		 220 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  40.89 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  39.73 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  40.44 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  39.73 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  40.71 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  39.29 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  38.33 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  41.33 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  39.65 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  35.84 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  35.56 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  37.05 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  42.04 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  38.77 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  34.96 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  40.1 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  43.43 
 
 		 199 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  40.27 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  39.21 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  39.21 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  39.21 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  39.21 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  36.16 
 
 		 217 aa  144  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  35.4 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  44 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  41.59 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  37.17 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  37.99 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  44.29 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  39.11 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  36.16 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  38.77 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  38.77 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  38.77 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  36.28 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  42.44 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  38.77 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  35.84 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  36.44 
 
 		 220 aa  141  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  41.24 
 
 		 187 aa  141  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  37.61 
 
 		 222 aa  141  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  40.57 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  36 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0714  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.854328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  43 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  42.21 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  37.05 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  38.38 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>