More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1180 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 267 aa  555  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  59.2 
 
 		 274 aa  318  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 275 aa  185  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  33.74 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  31.91 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  33.04 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  29.12 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  31.05 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 266 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 266 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  30.45 
 
 		 292 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 263 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  30.51 
 
 		 271 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  34.2 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  31.1 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  32.41 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  27.44 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 268 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 301 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  26.94 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 299 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  31.65 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  27.84 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  28.35 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3824  LuxR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 267 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00247699  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0389  LuxR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0350  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0630  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0768185  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1366  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0942  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232709  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2465  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.54611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1273  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1199  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1027  LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3294  LysR-family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42203  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4126  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3468  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0530935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3366  LysR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.857101 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3373  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  35.58 
 
 		 824 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 886 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 199 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02672  hypothetical protein  28.25 
 
 		 198 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  43.66 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3299  LysR-family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 227 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 260 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 209 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000464283  hitchhiker  0.00000781977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 248 aa  52.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3163  two component LuxR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 203 aa  52  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.932633  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  47.54 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3498  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 73 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 967 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 522 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2103  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.41 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 209 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>