104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0299 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  100 
 
 
273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  69.89 
 
 
271 aa  414  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  72.45 
 
 
283 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  71.7 
 
 
285 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  72.08 
 
 
283 aa  400  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  70.94 
 
 
285 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  70.94 
 
 
285 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  70.99 
 
 
289 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  64.18 
 
 
273 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  64.15 
 
 
295 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  61.9 
 
 
273 aa  357  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  63.43 
 
 
271 aa  355  5e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  62.45 
 
 
265 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  60.38 
 
 
276 aa  338  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  65.06 
 
 
285 aa  338  5e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  62.41 
 
 
286 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  51.12 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  33.94 
 
 
297 aa  155  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  33.21 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  32.68 
 
 
317 aa  122  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  34.05 
 
 
276 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  32.68 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  30.77 
 
 
305 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  32.47 
 
 
599 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  30.36 
 
 
305 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  29.34 
 
 
299 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  29.43 
 
 
276 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  29.12 
 
 
322 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  27.18 
 
 
326 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  30.48 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  30.43 
 
 
329 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  30.29 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  27.99 
 
 
325 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  27.24 
 
 
325 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  30.11 
 
 
272 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  28.47 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  27.39 
 
 
251 aa  85.9  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  32.64 
 
 
302 aa  85.5  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  30.41 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  28.46 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  26.46 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  27.76 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  26.83 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  27.56 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  28.62 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  26.37 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  25.44 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  27.5 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  28.21 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  28.69 
 
 
590 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  26.67 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  27.86 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  25.81 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  27.13 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  27.27 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  27.59 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  26.79 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  27.24 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  27.2 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  27.2 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  24.74 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  25.63 
 
 
297 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  27.78 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  27.96 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  25.72 
 
 
292 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  26.55 
 
 
296 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  24.91 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  27.65 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  28.74 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.91 
 
 
235 aa  52.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  28.44 
 
 
220 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2490  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.02 
 
 
220 aa  50.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124934 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25 
 
 
229 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  26.01 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.36 
 
 
220 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.35 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.4 
 
 
274 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.88 
 
 
237 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  27.43 
 
 
461 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  25.19 
 
 
633 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.25 
 
 
270 aa  45.8  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.84 
 
 
233 aa  45.8  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  24.89 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  26.12 
 
 
524 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  27.47 
 
 
233 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  38.46 
 
 
520 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  38.46 
 
 
520 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.89 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3847  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.34 
 
 
236 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584651  normal  0.485272 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  28.93 
 
 
234 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.57 
 
 
219 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.75 
 
 
233 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25 
 
 
233 aa  43.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4939  malonate decarboxylase, alpha subunit  36.96 
 
 
562 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.65 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3863  malonate decarboxylase, alpha subunit  36.96 
 
 
562 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1247  malonate decarboxylase, alpha subunit  34.41 
 
 
551 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2612  malonate decarboxylase, alpha subunit  35.48 
 
 
551 aa  42.7  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.799798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.19 
 
 
463 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  27.27 
 
 
302 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>