More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5089 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 619 aa  1290    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  46.09 
 
 		 630 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  44.3 
 
 		 623 aa  543  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  39.39 
 
 		 620 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  41.45 
 
 		 609 aa  488  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  41.49 
 
 		 654 aa  481  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  38.85 
 
 		 631 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  38.41 
 
 		 686 aa  452  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  38.1 
 
 		 665 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  38.78 
 
 		 639 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  37.17 
 
 		 774 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  36.64 
 
 		 778 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  36.96 
 
 		 765 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  36.48 
 
 		 786 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  39.17 
 
 		 641 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  37.4 
 
 		 665 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  37.02 
 
 		 644 aa  430  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  35.99 
 
 		 683 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  32.52 
 
 		 610 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  30 
 
 		 510 aa  198  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  31.07 
 
 		 511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  27.34 
 
 		 526 aa  171  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  30.72 
 
 		 838 aa  170  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  29.03 
 
 		 574 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  28.54 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  27.58 
 
 		 609 aa  161  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  26.51 
 
 		 600 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  29.49 
 
 		 814 aa  155  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  29.07 
 
 		 574 aa  155  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  26.1 
 
 		 836 aa  154  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  28.66 
 
 		 588 aa  150  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  27.19 
 
 		 586 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  26.8 
 
 		 586 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  29.34 
 
 		 582 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  29.51 
 
 		 589 aa  148  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  26.8 
 
 		 586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  27.38 
 
 		 524 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  23.56 
 
 		 528 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  26.89 
 
 		 614 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  23.56 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  27.85 
 
 		 481 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  25.21 
 
 		 562 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  27.81 
 
 		 587 aa  145  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  25.87 
 
 		 885 aa  145  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  26.68 
 
 		 703 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  24.83 
 
 		 533 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  25.21 
 
 		 610 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  26.9 
 
 		 586 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  25.41 
 
 		 610 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  26.56 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  28.22 
 
 		 509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  27.25 
 
 		 522 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  27.12 
 
 		 571 aa  141  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  26.68 
 
 		 564 aa  141  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  27.06 
 
 		 586 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  27.06 
 
 		 586 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  27.06 
 
 		 586 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  24.89 
 
 		 481 aa  140  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  27.06 
 
 		 586 aa  140  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  26.35 
 
 		 586 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  27.23 
 
 		 586 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  25.51 
 
 		 620 aa  140  8.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  29.27 
 
 		 1021 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  26.64 
 
 		 649 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  29.11 
 
 		 584 aa  138  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  26.62 
 
 		 586 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  28.17 
 
 		 515 aa  135  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  25.73 
 
 		 635 aa  135  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  26.74 
 
 		 472 aa  134  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  25.7 
 
 		 589 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  25.97 
 
 		 481 aa  134  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  26.82 
 
 		 642 aa  133  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  27.38 
 
 		 583 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  26.91 
 
 		 499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  26.23 
 
 		 484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  27.85 
 
 		 576 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  26.27 
 
 		 595 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  26.04 
 
 		 2638 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  26.6 
 
 		 599 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  29.92 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  25.05 
 
 		 686 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  26.89 
 
 		 558 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  25.76 
 
 		 593 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  26.49 
 
 		 767 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.32 
 
 		 1891 aa  128  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  25.05 
 
 		 690 aa  128  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  25.64 
 
 		 1942 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  28.81 
 
 		 493 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  24.36 
 
 		 496 aa  127  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  25.24 
 
 		 488 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  27.95 
 
 		 583 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  25.87 
 
 		 644 aa  127  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  28.33 
 
 		 622 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  28.29 
 
 		 593 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  26.8 
 
 		 580 aa  126  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  23.29 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  26.85 
 
 		 752 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  25.81 
 
 		 555 aa  125  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 		 483 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  25.1 
 
 		 654 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>