180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1662 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1767  glutamine synthetase catalytic region  47.81 
 
 		 722 aa  687    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.852052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3079  glutamine synthetase catalytic region  47.15 
 
 		 695 aa  675    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0136048  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1413  glutamine synthetase  46.59 
 
 		 727 aa  683    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.504346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1588  glutamine synthetase  48.66 
 
 		 714 aa  697    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.770876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0102  glutamine synthetase, type III  45.97 
 
 		 726 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0922  glutamine synthetase catalytic region  47.72 
 
 		 695 aa  673    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0961965  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0169  glutamate-ammonia ligase, glutamine synthetase type III  45.74 
 
 		 723 aa  642    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1203  glutamine synthetase, catalytic region  46.89 
 
 		 718 aa  666    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0674582  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1182  glutamine synthetase catalytic region  47.29 
 
 		 695 aa  675    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000468227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2431  glutamine synthetase catalytic region  58.94 
 
 		 729 aa  896    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66127  normal  0.344974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1735  glutamine synthetase  63.17 
 
 		 724 aa  946    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0919  glutamine synthetase catalytic region  47.53 
 
 		 712 aa  694    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3062  glutamine synthetase catalytic region  49.01 
 
 		 721 aa  696    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0974057  normal  0.901387 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07500  glutamine synthetase  61.06 
 
 		 727 aa  911    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1682  glutamine synthetase, catalytic region  46.65 
 
 		 695 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249819  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0832  glutamine synthetase, catalytic region  47.83 
 
 		 714 aa  696    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.215795  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1258  glutamine synthetase catalytic region  46.69 
 
 		 703 aa  643    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000233651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1590  glutamine synthetase catalytic region  46.79 
 
 		 726 aa  667    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1496  glutamine synthetase catalytic region  47.2 
 
 		 727 aa  662    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4030  glutamine synthetase, catalytic region  45.73 
 
 		 725 aa  635    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.512173  normal  0.618275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1805  glutamine synthetase, catalytic region  45.71 
 
 		 726 aa  654    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1252  glutamine synthetase catalytic region  46.51 
 
 		 711 aa  639    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0196  glutamine synthetase, catalytic region  47.04 
 
 		 697 aa  652    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0863  L-glutamine synthetase  47.9 
 
 		 705 aa  671    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1539  L-glutamine synthetase  48.58 
 
 		 701 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2842  glutamine synthetase catalytic region  48.66 
 
 		 716 aa  686    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2345  glutamine synthetase, catalytic region  62.28 
 
 		 729 aa  945    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2977  glutamine synthetase catalytic region  64.67 
 
 		 728 aa  993    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0953  glutamine synthetase catalytic region  46.93 
 
 		 713 aa  693    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2149  glutamine synthetase catalytic region  47.44 
 
 		 734 aa  682    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1327  glutamine synthetase catalytic region  47.72 
 
 		 697 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.877052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1662  glutamine synthetase catalytic region  100 
 
 		 732 aa  1519    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2272  glutamine synthetase catalytic region  45.31 
 
 		 723 aa  640    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3374  glutamine synthetase catalytic region  47.16 
 
 		 702 aa  655    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.930372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0554  glutamine synthetase, catalytic region  47.59 
 
 		 699 aa  669    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204276  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0960  glutamine synthetase catalytic region  60.96 
 
 		 723 aa  915    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.879231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0446  glutamine synthetase catalytic region  58.72 
 
 		 728 aa  876    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00602477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1618  glutamine synthetase catalytic region  46.89 
 
 		 717 aa  659    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00970811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1521  glutamine synthetase catalytic region  47.08 
 
 		 714 aa  679    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00188531  normal  0.582625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4424  glutamine synthetase catalytic region  45.39 
 
 		 721 aa  635  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0561  glutamine synthetase catalytic region  45.03 
 
 		 697 aa  629  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0566377  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3485  glutamine synthetase, type III  43.79 
 
 		 724 aa  629  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.896622  normal  0.242716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2596  glutamine synthetase, catalytic region  45.3 
 
 		 725 aa  628  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0085  glutamine synthetase catalytic region  45.7 
 
 		 695 aa  624  1e-177  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1921  glutamine synthetase catalytic region  44.12 
 
 		 733 aa  618  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0370  glutamine synthetase catalytic region  45.25 
 
 		 696 aa  616  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1593  glutamine synthetase catalytic region  42.16 
 
 		 730 aa  617  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0340471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0107  glutamine synthetase catalytic region  44.46 
 
 		 723 aa  616  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1105  glutamine synthetase catalytic region  44.29 
 
 		 697 aa  612  9.999999999999999e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4041  glutamine synthetase catalytic region  42.86 
 
 		 722 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0239813 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01740  glutamine synthetase  42.72 
 
 		 706 aa  609  1e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.206794  hitchhiker  0.0000000986897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1311  glutamine synthetase catalytic region  43.61 
 
 		 723 aa  606  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4201  glutamine synthetase, catalytic region  43.41 
 
 		 724 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.856805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13790  glutamine synthetase  43.99 
 
 		 729 aa  600  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2341  glutamine synthetase catalytic region  45.47 
 
 		 702 aa  593  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19890  glutamine synthetase  43.26 
 
 		 697 aa  588  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1149  glutamine synthetase catalytic region  44.22 
 
 		 730 aa  588  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1272  glutamine synthetase catalytic region  40.45 
 
 		 699 aa  544  1e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000566938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0442  glutamine synthetase catalytic region  39.97 
 
 		 688 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0752  glutamine synthetase catalytic region  39.43 
 
 		 676 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39960  predicted protein  37 
 
 		 688 aa  444  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22357  GLNA, glutamine synthase  36.5 
 
 		 716 aa  417  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.10441  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2754  glutamine synthetase, catalytic region  36.73 
 
 		 450 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2798  glutamine synthetase, catalytic region  36.73 
 
 		 450 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2657  glutamine synthetase catalytic region  29.5 
 
 		 474 aa  56.6  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2784  glutamine synthetase, catalytic region  36.73 
 
 		 450 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2715  glutamine synthetase, catalytic region  33.58 
 
 		 476 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.846118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  34.21 
 
 		 447 aa  54.3  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3319  glutamine synthetase, catalytic region  31.31 
 
 		 453 aa  54.3  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.537812  normal  0.0587304 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  29.37 
 
 		 444 aa  53.9  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  30.89 
 
 		 455 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1141  glutamine synthetase catalytic region  34.38 
 
 		 473 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  31.21 
 
 		 444 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  33.64 
 
 		 471 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  28.32 
 
 		 448 aa  53.1  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  33.65 
 
 		 450 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2920  glutamine synthetase, catalytic region  29.93 
 
 		 442 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328633 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  37.62 
 
 		 430 aa  52.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  34.57 
 
 		 446 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  34.57 
 
 		 446 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2494  glutamine synthetase catalytic region  35.42 
 
 		 476 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.939513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  34.57 
 
 		 446 aa  52  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  32.93 
 
 		 445 aa  52  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  31.82 
 
 		 447 aa  51.6  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  31.73 
 
 		 439 aa  51.6  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  31.9 
 
 		 442 aa  51.6  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 440 aa  51.6  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  29.69 
 
 		 431 aa  51.2  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  28.57 
 
 		 444 aa  50.8  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  33.33 
 
 		 433 aa  50.8  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  29.69 
 
 		 455 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11906  glutamine synthetase glnA3  26.21 
 
 		 450 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 444 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  27.64 
 
 		 448 aa  50.4  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  34.31 
 
 		 447 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  37.21 
 
 		 444 aa  50.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  31.91 
 
 		 445 aa  50.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 445 aa  50.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  28.1 
 
 		 466 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  34.15 
 
 		 443 aa  50.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>