More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2521 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  72.53 
 
 		 583 aa  860    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  76.86 
 
 		 579 aa  884    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  70.38 
 
 		 585 aa  829    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  71.23 
 
 		 584 aa  848    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  65.97 
 
 		 587 aa  761    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 583 aa  1199    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  66.9 
 
 		 584 aa  776    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  38.57 
 
 		 607 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.74 
 
 		 621 aa  291  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.35 
 
 		 596 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6611  60 kDa inner membrane insertion protein  31.6 
 
 		 617 aa  264  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290121  normal  0.0199221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2587  60 kDa inner membrane insertion protein  30.51 
 
 		 600 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0340574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1150  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.46 
 
 		 602 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333218  decreased coverage  0.00602156 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.25 
 
 		 622 aa  247  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2557  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.71 
 
 		 620 aa  240  5.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0157093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  31 
 
 		 542 aa  233  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2384  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.62 
 
 		 636 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850745  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0158  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.16 
 
 		 621 aa  227  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.413762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  30.02 
 
 		 553 aa  220  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  29.03 
 
 		 542 aa  213  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  31.26 
 
 		 559 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  32.59 
 
 		 536 aa  210  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  29.23 
 
 		 528 aa  206  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.8 
 
 		 575 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.71 
 
 		 545 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  32.6 
 
 		 537 aa  203  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  29.16 
 
 		 530 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  27.81 
 
 		 557 aa  201  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  28.4 
 
 		 545 aa  200  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.33 
 
 		 567 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  32.95 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2197  60 kDa inner membrane insertion protein  27.09 
 
 		 551 aa  194  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.297594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.09 
 
 		 544 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.64 
 
 		 560 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.57 
 
 		 557 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.39 
 
 		 560 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.88 
 
 		 552 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.09 
 
 		 543 aa  194  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.34 
 
 		 560 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  27.22 
 
 		 542 aa  193  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.62 
 
 		 560 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0526  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.93 
 
 		 627 aa  193  8e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.710508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  29.87 
 
 		 547 aa  193  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.55 
 
 		 578 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  29.98 
 
 		 552 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.29 
 
 		 552 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.28 
 
 		 578 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  29.26 
 
 		 531 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  32.13 
 
 		 539 aa  191  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  26.9 
 
 		 556 aa  191  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.75 
 
 		 543 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.38 
 
 		 550 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  27.84 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.1 
 
 		 541 aa  189  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.26 
 
 		 550 aa  188  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.36 
 
 		 554 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2122  inner membrane protein oxaA  28.95 
 
 		 566 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.17 
 
 		 554 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4506  60 kDa inner membrane insertion protein  29.09 
 
 		 549 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.417541  normal  0.699877 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  28.95 
 
 		 566 aa  187  6e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  25.9 
 
 		 556 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  25.9 
 
 		 556 aa  187  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.52 
 
 		 581 aa  186  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  28.83 
 
 		 557 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  31.38 
 
 		 544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  33 
 
 		 546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  33 
 
 		 546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.61 
 
 		 557 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.21 
 
 		 543 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  33 
 
 		 546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.92 
 
 		 558 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.45 
 
 		 531 aa  184  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.92 
 
 		 558 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.92 
 
 		 558 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.92 
 
 		 558 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  31.11 
 
 		 544 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.92 
 
 		 558 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.92 
 
 		 558 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.21 
 
 		 552 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  30.53 
 
 		 551 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.21 
 
 		 553 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.92 
 
 		 558 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.21 
 
 		 552 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.38 
 
 		 560 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  30.95 
 
 		 541 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.91 
 
 		 555 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.4 
 
 		 548 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.4 
 
 		 548 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.4 
 
 		 548 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.4 
 
 		 548 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.4 
 
 		 548 aa  184  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  30.69 
 
 		 541 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  30.69 
 
 		 541 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  30.69 
 
 		 541 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  30.92 
 
 		 545 aa  183  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  25.69 
 
 		 589 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.41 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  33.03 
 
 		 559 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  32.89 
 
 		 548 aa  182  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.89 
 
 		 548 aa  182  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>