208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2787 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2787  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 296 aa  564  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3429  RpiR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 274 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3314  transcriptional regulator, RpiR family  45.36 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0931  RpiR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 279 aa  221  9e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0628212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3470  transcriptional regulator, RpiR family  44.64 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3450  RpiR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3191  RpiR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3330  RpiR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 277 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0906  transcriptional regulator, RpiR family  44.17 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.505749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0876  transcriptional regulator, RpiR family  44.17 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2080  transcriptional regulator, RpiR family  44.93 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2057  RpiR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 272 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0450  RpiR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02491  putative rpiR-family transcriptional regulatory protein  34.08 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1233  RpiR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0156819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3411  transcriptional regulator, RpiR family  34.19 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2659  RpiR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1331  RpiR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0160  RpiR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1407  RpiR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 280 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4066  RpiR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 303 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4532  RpiR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.872483  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1500  RpiR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2428  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  30.48 
 
 		 272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.451037  normal  0.0398697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0959  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.396174 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2981  RpiR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4542  RpiR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7853  putative transcriptional regulator, RpiR family  34.25 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0397  sugar isomerase (SIS)  27.91 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0343  RpiR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1411  transcriptional regulator, RpiR family  32.52 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1966  transcriptional regulator, RpiR family  32.37 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.166735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72650  hypothetical protein  32.97 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6307  hypothetical protein  33.82 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1915  RpiR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2324  RpiR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3592  RpiR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2372  transcriptional regulator, RpiR family  31.09 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2180  RpiR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6012  transcriptional regulator, RpiR family  28.57 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4354  RpiR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339513  unclonable  0.00000424592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4871  RpiR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211871  hitchhiker  0.00000205236 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0998  RpiR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.962944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2324  RpiR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284245  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1605  RpiR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3693  RpiR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00637499  normal  0.371267 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2788  RpiR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.293627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5365  RpiR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00401037  normal  0.0909381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0770  RpiR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666696  hitchhiker  0.00646712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1136  transcriptional regulator, RpiR family  24.16 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1872  RpiR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.199866  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5348  RpiR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.391246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2059  RpiR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3445  RpiR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149889  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4922  RpiR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820717  normal  0.0573558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3194  RpiR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5218  RpiR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.398124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2807  RpiR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0983  transcriptional regulator, RpiR family  24.06 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  normal  0.847459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1368  RpiR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1405  RpiR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0502817  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  21.26 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4477  RpiR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600704  normal  0.42821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  21.48 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3779  RpiR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5716  RpiR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0748827 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4589  RpiR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0684  putative transcriptional regulator  27.24 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615346  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  23.39 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3479  transcriptional regulator, RpiR family  29.06 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4060  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3702  RpiR family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4736  RpiR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4015  RpiR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0260  transcriptional regulator, RpiR family  29.41 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1140  RpiR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2922  RpiR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2412  transcriptional regulator, RpiR family  26.18 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0674  RpiR family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3609  RpiR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal  0.0456005 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0730  transcriptional regulator, putative  26.91 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3695  RpiR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3836  RpiR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5469  transcriptional regulator, RpiR family  24.54 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2832  RpiR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.233384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3563  RpiR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  25.43 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1255  RpiR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1048  RpiR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656408  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2133  RpiR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3669  transcriptional regulator, RpiR family  30.83 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2796  RpiR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4675  RpiR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0109313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3346  transcriptional regulator, RpiR family  31.45 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3876  RpiR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  31.46 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1764  SIS domain-containing protein  26.72 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000384783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3344  transcriptional regulator, RpiR family  24.91 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0142  RpiR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1822  RpiR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>