More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2780 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2780  Amidase  100 
 
 
579 aa  1082    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222213  hitchhiker  0.0000220235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2081  Amidase  48.07 
 
 
546 aa  342  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17220  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  46.97 
 
 
535 aa  325  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2085  amidase  48.97 
 
 
399 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.071068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2055  amidase  40.41 
 
 
405 aa  230  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.478498  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1059  amidase  44.41 
 
 
405 aa  229  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178849  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1184  amidase  40.4 
 
 
392 aa  226  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4553  amidase  44.11 
 
 
400 aa  223  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.908293  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1572  hypothetical protein  44.76 
 
 
408 aa  223  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0527847  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4246  amidase  43.02 
 
 
395 aa  217  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0451  amidase  40.46 
 
 
411 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4057  amidase  46.13 
 
 
393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02494  amidase  41.69 
 
 
423 aa  212  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.245723  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0862  Amidase  41.09 
 
 
391 aa  209  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.272163  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5699  Amidase  38.3 
 
 
386 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6652  Amidase  39.14 
 
 
378 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585485  normal  0.0361109 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17396  predicted protein  38.25 
 
 
576 aa  199  9e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.281146 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0091  amidase  42.29 
 
 
401 aa  199  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0909463  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0099  amidase  42.29 
 
 
401 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2426  amidase  36.49 
 
 
398 aa  196  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.771538  normal  0.022495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5251  Amidase  42.9 
 
 
399 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0243  amidase  41.33 
 
 
389 aa  193  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1937  amidase  40.06 
 
 
396 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0207293  normal  0.545552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0848  amidase  41.13 
 
 
393 aa  187  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0385  amidase  39.95 
 
 
394 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2714  amidase  42.23 
 
 
395 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0950  amidase family protein  38.06 
 
 
341 aa  155  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.926535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3904  amidase  36.44 
 
 
449 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793925  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3155  amidase  42.53 
 
 
364 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0626619 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3815  amidase  37.8 
 
 
408 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0362  amidase  31.12 
 
 
423 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0472212  normal  0.965873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2939  amidase  30.39 
 
 
411 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.331336 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3448  Amidase  34.77 
 
 
447 aa  134  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2696  amidase  36.86 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0910993  normal  0.599715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2215  amidase  36.28 
 
 
379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654592  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1052  amidase  41.39 
 
 
369 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  34.62 
 
 
459 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4367  Amidase  39.12 
 
 
416 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1685  putative amidase  29.91 
 
 
388 aa  123  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2851  amidase  35.56 
 
 
413 aa  123  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4204  amidase family protein  35.14 
 
 
442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0755  amidase  31.86 
 
 
388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0426  amidase  32.29 
 
 
440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2100  putative Asp-tRNA Asn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  36.69 
 
 
374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733872  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2164  Amidase  35.03 
 
 
374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4752  amidase  34.5 
 
 
457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1444  amidase  34.16 
 
 
456 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.223813  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0303  Amidase  32.67 
 
 
511 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  35.03 
 
 
463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1352  amidase  36.32 
 
 
395 aa  119  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.177087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4187  amidase  37.24 
 
 
377 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3938  hypothetical protein  34.19 
 
 
457 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3586  amidase  35.37 
 
 
449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2277  amidase  34.67 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1927  amidase  33.8 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226635  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4054  amidase  33.06 
 
 
467 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200253  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2771  amidase  43.09 
 
 
453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.4 
 
 
491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5348  amidase  34.44 
 
 
374 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.634434  normal  0.827803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2686  amidase  32.98 
 
 
437 aa  114  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2690  amidase  33.66 
 
 
449 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  34.08 
 
 
440 aa  113  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3581  amidase  34.41 
 
 
422 aa  113  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.854746  normal  0.0626995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  47.7 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5086  amidase  48.37 
 
 
374 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.752662 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0320  pyrazinamidase/nicotinamidase  48.34 
 
 
375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3518  amidase  48.12 
 
 
374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0590183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2503  amidase  47.5 
 
 
374 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  34.67 
 
 
454 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1988  amidase  34.48 
 
 
469 aa  110  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.616818  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3908  amidase  46.88 
 
 
374 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3744  amidase  33.33 
 
 
427 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  48.24 
 
 
467 aa  110  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  43.64 
 
 
449 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 
475 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0756  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.31 
 
 
431 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  31.69 
 
 
456 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1388  amidase  43.98 
 
 
451 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1993  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  37.02 
 
 
426 aa  107  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.348546 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2671  amidase  36 
 
 
441 aa  107  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1757  amidase  34.17 
 
 
450 aa  107  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.906922  normal  0.0809775 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  34.27 
 
 
456 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3612  amidase  46.25 
 
 
374 aa  107  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1824  Amidase  29.28 
 
 
398 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2208  amidase  33.22 
 
 
511 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0822  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.45 
 
 
431 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.578935  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0065  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.31 
 
 
431 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369557  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1162  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29 
 
 
431 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.894545  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5708  Amidase  31.4 
 
 
447 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549734  normal  0.148975 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0872  amidase  49.38 
 
 
400 aa  104  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2934  amidase  33.02 
 
 
450 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2421  amidase  40.59 
 
 
511 aa  104  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  44.51 
 
 
448 aa  103  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1007  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.18 
 
 
434 aa  103  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  39.77 
 
 
464 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  30.77 
 
 
452 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1651  allophanate hydrolase  33.23 
 
 
601 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426553  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1688  amidase  34.94 
 
 
449 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.481461  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.87 
 
 
479 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0058  amidase  32.49 
 
 
443 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.633251  normal  0.72229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>