206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3618 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3618  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 384 aa  770    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1325  aldose 1-epimerase  58.67 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  normal  0.426674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4631  aldose 1-epimerase  56.82 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2369  aldose 1-epimerase  49.87 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0104312  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2636  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 382 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3731  aldose 1-epimerase  48.44 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.90424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0738  aldose 1-epimerase  51.85 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.547855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3076  aldose 1-epimerase  49 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.313504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0474  Aldose 1-epimerase  50.42 
 
 		 383 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.561665  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1269  Aldose 1-epimerase  51.53 
 
 		 414 aa  341  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0872441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1235  Aldose 1-epimerase  48.73 
 
 		 387 aa  341  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0621  Aldose 1-epimerase  51.85 
 
 		 388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.0428145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0799  aldose 1-epimerase  47.77 
 
 		 397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2135  galactose mutarotase  49.86 
 
 		 359 aa  335  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0819  aldose 1-epimerase  46.84 
 
 		 351 aa  333  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1153  Aldose 1-epimerase  47.93 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2820  Aldose 1-epimerase  46.72 
 
 		 380 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1386  aldose 1-epimerase  44.44 
 
 		 384 aa  323  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0321  aldose 1-epimerase  47.26 
 
 		 375 aa  322  9.000000000000001e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.520613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0489  Aldose 1-epimerase  47.01 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1457  aldose 1-epimerase  47.04 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6371  aldose 1-epimerase  47.04 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2311  aldose 1-epimerase  50 
 
 		 355 aa  316  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5369  aldose 1-epimerase  47.33 
 
 		 387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1020  aldose 1-epimerase  48.3 
 
 		 355 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1122  aldose 1-epimerase  43.58 
 
 		 392 aa  312  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1187  aldose 1-epimerase  44.41 
 
 		 354 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1182  aldose 1-epimerase  46.33 
 
 		 356 aa  311  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7038  aldose 1-epimerase  47.46 
 
 		 387 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.754242  normal  0.230743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2977  Aldose 1-epimerase  47.55 
 
 		 397 aa  309  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.416586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0788  aldose 1-epimerase  45.04 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000118587  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3008  Aldose 1-epimerase  47.13 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4369  Aldose 1-epimerase  45.21 
 
 		 372 aa  305  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.0127022 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6480  aldose 1-epimerase  46.61 
 
 		 390 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0142424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5727  aldose 1-epimerase  46.61 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2727  Aldose 1-epimerase  45.58 
 
 		 390 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4114  aldose 1-epimerase  45.11 
 
 		 346 aa  301  9e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0655  aldose 1-epimerase  47.88 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0630  aldose 1-epimerase  47.88 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2993  Aldose 1-epimerase  44.67 
 
 		 346 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.862423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1210  aldose 1-epimerase  44.69 
 
 		 347 aa  298  9e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00282737  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1758  aldose 1-epimerase  44.44 
 
 		 372 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365517  normal  0.11441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3011  Aldose 1-epimerase  43.33 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415447  hitchhiker  0.00870507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3099  Aldose 1-epimerase  44.25 
 
 		 346 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1039  Aldose 1-epimerase  44.19 
 
 		 357 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2026  aldose 1-epimerase  43.02 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.564676  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2873  aldose 1-epimerase  43.68 
 
 		 346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  46.79 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1611  aldose 1-epimerase  40.51 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0628258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1431  Aldose 1-epimerase  41.38 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1805  aldose 1-epimerase  41.76 
 
 		 385 aa  279  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3640  Aldose 1-epimerase  44.44 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1632  aldose 1-epimerase  39.71 
 
 		 355 aa  276  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3154  aldose 1-epimerase  45.8 
 
 		 350 aa  276  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1147  aldose 1-epimerase  43.32 
 
 		 368 aa  275  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.934595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1503  Aldose 1-epimerase  43.93 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3593  Aldose 1-epimerase  42.98 
 
 		 355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00379165  hitchhiker  0.0000198106 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0556  aldose 1-epimerase  38.7 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000526339  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002663  aldose 1-epimerase  42.82 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0282  Aldose 1-epimerase  44.83 
 
 		 357 aa  259  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22783  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2344  aldose 1-epimerase  41.95 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145267 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2146  Aldose 1-epimerase  39.17 
 
 		 351 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316163  normal  0.370684 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2713  Aldose 1-epimerase  42.65 
 
 		 348 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2682  aldose 1-epimerase  38.75 
 
 		 406 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4205  aldose 1-epimerase  40.5 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3100  aldose 1-epimerase  40.81 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2723  Aldose 1-epimerase  40.75 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2336  aldose 1-epimerase  41.09 
 
 		 376 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.360362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2506  aldose 1-epimerase  39.13 
 
 		 355 aa  236  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2946  aldose 1-epimerase  39.53 
 
 		 356 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1033  aldose 1-epimerase  41.62 
 
 		 341 aa  236  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.391794  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2858  aldose 1-epimerase  39.53 
 
 		 356 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.852671  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6030  aldose 1-epimerase  40.23 
 
 		 362 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6330  aldose 1-epimerase  40.52 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6508  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6742  aldose 1-epimerase  40 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.547611 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1344  aldose 1-epimerase  38.24 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3534  aldose 1-epimerase  37.08 
 
 		 360 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1247  aldose 1-epimerase  38.84 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.942743  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2072  aldose 1-epimerase  37.35 
 
 		 351 aa  233  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0156594  hitchhiker  0.00000257166 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6331  aldose 1-epimerase  39.72 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02261  aldose 1-epimerase  39.37 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1985  aldose 1-epimerase  37.06 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0318773  normal  0.0314397 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2018  galactose mutarotase  37.79 
 
 		 357 aa  229  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.237722  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1551  aldose 1-epimerase  37.35 
 
 		 340 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1290  galactose mutarotase  37.21 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.994264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00230  aldose 1-epimerase  37.18 
 
 		 340 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2060  aldose 1-epimerase  37.76 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.573655  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1989  aldose 1-epimerase  36.76 
 
 		 351 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0839729  unclonable  0.000022242 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4072  Aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 360 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4184  Aldose 1-epimerase  37.43 
 
 		 360 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2212  aldose 1-epimerase  36.02 
 
 		 347 aa  225  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.939522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2906  aldose 1-epimerase  37.18 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.336239 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2886  galactose mutarotase  37.18 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0779  aldose 1-epimerase  37.18 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0677  aldose 1-epimerase  37.18 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.569185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0783  aldose 1-epimerase  37.18 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0810  aldose 1-epimerase  37.18 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3804  Aldose 1-epimerase  40.06 
 
 		 340 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.437694 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1264  aldose 1-epimerase  37.1 
 
 		 348 aa  222  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>