178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7952 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
206 aa  403  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.56 
 
 
195 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  43.08 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7538  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  43.96 
 
 
232 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.763652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  39.25 
 
 
210 aa  121  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.69 
 
 
205 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  33.15 
 
 
212 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.5 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11470  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  37.38 
 
 
230 aa  95.9  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241013  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  31.07 
 
 
202 aa  72  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  32.93 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  30.92 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  27.62 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40 
 
 
216 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  27.89 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  27.89 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  28.1 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.14 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.31 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  36.3 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  27 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.19 
 
 
205 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  27.37 
 
 
196 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  30.1 
 
 
214 aa  58.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  27.62 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  35.71 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  44.87 
 
 
133 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.09 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  27.37 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  27 
 
 
205 aa  56.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.71 
 
 
204 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  29.21 
 
 
201 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.81 
 
 
209 aa  54.7  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.64 
 
 
200 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.74 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  30.95 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  32.61 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  31.85 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  26.84 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.29 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  25.64 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  29.26 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  34.35 
 
 
218 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  32.5 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  35.05 
 
 
198 aa  51.6  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  25.91 
 
 
206 aa  51.6  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.28 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.45 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0542  HAD family hydrolase  28.64 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0173803  normal  0.811025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.77 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  32.04 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0496  HAD superfamily hydrolase  28.35 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  32.43 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  27.87 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  28.85 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  28.85 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  28.85 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  22.99 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  28.85 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  28.85 
 
 
199 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  28.07 
 
 
234 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  24.02 
 
 
216 aa  48.5  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.06 
 
 
211 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.28 
 
 
220 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  38.18 
 
 
211 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0164  HAD family hydrolase  28.81 
 
 
220 aa  48.5  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  40 
 
 
200 aa  48.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  30.53 
 
 
211 aa  48.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  31.96 
 
 
163 aa  48.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  25.41 
 
 
196 aa  48.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.99 
 
 
228 aa  48.5  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  29.02 
 
 
202 aa  48.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  28.07 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  26.9 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  27.78 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0167  HAD family hydrolase  26.28 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.86 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
234 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0160  HAD family hydrolase  27.97 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  27.32 
 
 
205 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0177  HAD family hydrolase  28.83 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.69 
 
 
298 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.36 
 
 
214 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  31.21 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  35.35 
 
 
204 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  27.12 
 
 
220 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  26.67 
 
 
223 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  30.48 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.48 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0222  HAD family hydrolase  26.92 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  30.48 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0162  HAD family hydrolase  26.28 
 
 
220 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  30.48 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3556  HAD family hydrolase  25 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.99 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  30.48 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  30.48 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  30.48 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  30.48 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>