More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7238 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7238  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 474 aa  902    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1264  major facilitator superfamily MFS_1  55.09 
 
 		 466 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0388  major facilitator transporter  54.37 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00816882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0277  major facilitator superfamily MFS_1  41.34 
 
 		 594 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein, putative  37.93 
 
 		 482 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3033  major facilitator family transporter  37.08 
 
 		 483 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1266  MFS family transporter  37.08 
 
 		 476 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1015  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 479 aa  180  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.449105 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0877  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 458 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.35 
 
 		 529 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.29 
 
 		 537 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.03 
 
 		 539 aa  99  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.72 
 
 		 685 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.63 
 
 		 539 aa  98.2  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.61 
 
 		 538 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.46 
 
 		 539 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.21 
 
 		 558 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 470 aa  96.3  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 523 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.94 
 
 		 514 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.51 
 
 		 493 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.31 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.68 
 
 		 478 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.68 
 
 		 478 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.21 
 
 		 534 aa  94  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  26.36 
 
 		 481 aa  93.6  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  30.44 
 
 		 790 aa  93.2  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.34 
 
 		 488 aa  93.2  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  23.13 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.96 
 
 		 474 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.6 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.54 
 
 		 502 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  25.68 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.68 
 
 		 541 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.8 
 
 		 545 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4530  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 488 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3692  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 479 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.378275  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0554  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 531 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.35 
 
 		 512 aa  91.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3833  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 488 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.65 
 
 		 549 aa  91.3  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.57 
 
 		 476 aa  91.3  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  25.23 
 
 		 478 aa  90.9  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.51 
 
 		 478 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2662  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 531 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.56 
 
 		 509 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.64 
 
 		 469 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.47 
 
 		 523 aa  90.1  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.51 
 
 		 479 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.51 
 
 		 479 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 506 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.76 
 
 		 431 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.45 
 
 		 528 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.4 
 
 		 678 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  24.67 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.7 
 
 		 456 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  26.29 
 
 		 530 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3490  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 503 aa  89  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.691229 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  26.32 
 
 		 465 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.63 
 
 		 697 aa  88.2  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 		 485 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 465 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 478 aa  88.2  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.31 
 
 		 528 aa  88.2  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.83 
 
 		 524 aa  87.4  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 494 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 470 aa  87.8  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.49 
 
 		 501 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.82 
 
 		 458 aa  87.4  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4020  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.32 
 
 		 518 aa  87  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.1 
 
 		 534 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.82 
 
 		 493 aa  87  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.06 
 
 		 480 aa  87  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.91 
 
 		 680 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2133  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518616  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2795  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2745  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2771  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.15 
 
 		 567 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01490  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.46 
 
 		 624 aa  84.7  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3744  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.93 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6073  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.78 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.93 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.14 
 
 		 527 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.63 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.8 
 
 		 565 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.98 
 
 		 534 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.22 
 
 		 529 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>