58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3707 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 1000 aa  1977    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  36.08 
 
 		 1091 aa  309  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.66 
 
 		 1410 aa  298  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.22 
 
 		 1212 aa  287  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  41.02 
 
 		 2073 aa  281  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.77 
 
 		 823 aa  268  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1213 aa  255  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  31.5 
 
 		 671 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  31.62 
 
 		 675 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.98 
 
 		 1448 aa  222  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.37 
 
 		 1109 aa  212  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1200 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.32 
 
 		 584 aa  193  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  27.01 
 
 		 1418 aa  191  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  29.05 
 
 		 1085 aa  187  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  26.99 
 
 		 981 aa  139  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.64 
 
 		 933 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.75 
 
 		 809 aa  105  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  34.13 
 
 		 790 aa  95.5  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  39.39 
 
 		 1207 aa  81.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6906  glycoside hydrolase family 16  43.7 
 
 		 628 aa  80.9  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00349487  hitchhiker  0.000227833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  36.17 
 
 		 1128 aa  78.2  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3331  carbohydrate-binding family 6 protein  33.13 
 
 		 747 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  35.43 
 
 		 401 aa  74.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  34.81 
 
 		 540 aa  73.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  32.43 
 
 		 1016 aa  68.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  36.69 
 
 		 649 aa  68.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  37.24 
 
 		 847 aa  65.1  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  32.2 
 
 		 918 aa  64.7  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  35 
 
 		 815 aa  62  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  33.83 
 
 		 554 aa  61.2  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  27.53 
 
 		 982 aa  59.7  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  34.76 
 
 		 938 aa  59.3  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  26.48 
 
 		 1391 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  28.21 
 
 		 610 aa  57  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  32.03 
 
 		 870 aa  56.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  27.34 
 
 		 877 aa  56.2  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  30.97 
 
 		 772 aa  52.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1855  Carbohydrate binding family 6  33.57 
 
 		 892 aa  52.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  26.94 
 
 		 807 aa  51.2  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0277  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  34.26 
 
 		 469 aa  50.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  32.74 
 
 		 700 aa  51.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  35.82 
 
 		 574 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4674  glycoside hydrolase family 5  41.18 
 
 		 443 aa  50.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  25.93 
 
 		 569 aa  49.7  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  34.04 
 
 		 769 aa  49.7  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  31.88 
 
 		 820 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.19 
 
 		 372 aa  47  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  30.17 
 
 		 922 aa  47  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.57 
 
 		 831 aa  47  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4296  carbohydrate-binding family 6 protein  27.08 
 
 		 767 aa  46.2  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  31.85 
 
 		 705 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1071  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 728 aa  46.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.535323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04681  putative secreted protein  31.06 
 
 		 700 aa  46.2  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  40.54 
 
 		 1338 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  29.79 
 
 		 511 aa  45.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2293  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.64 
 
 		 372 aa  45.1  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1167 aa  44.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>