66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3231 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  100 
 
 		 659 aa  1304    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  38.79 
 
 		 674 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  39.55 
 
 		 681 aa  402  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  38.48 
 
 		 672 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  33.71 
 
 		 712 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  39.21 
 
 		 678 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  35.91 
 
 		 662 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  38.99 
 
 		 678 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  36.83 
 
 		 655 aa  358  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  39.12 
 
 		 675 aa  358  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  35.66 
 
 		 657 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  35.66 
 
 		 657 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  34.05 
 
 		 660 aa  351  3e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  41.34 
 
 		 692 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  40.21 
 
 		 693 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  33.59 
 
 		 659 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  40.36 
 
 		 693 aa  339  8e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  34.66 
 
 		 659 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  32.39 
 
 		 661 aa  333  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  34.21 
 
 		 659 aa  331  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  35.01 
 
 		 661 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  36.71 
 
 		 657 aa  327  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  35.2 
 
 		 663 aa  324  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.63 
 
 		 662 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  36.56 
 
 		 668 aa  312  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  32.71 
 
 		 687 aa  308  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  34.06 
 
 		 686 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  31.15 
 
 		 663 aa  300  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  37.25 
 
 		 641 aa  299  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  36.59 
 
 		 660 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  34.54 
 
 		 610 aa  294  3e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  28.15 
 
 		 672 aa  278  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  32.36 
 
 		 652 aa  277  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  35.44 
 
 		 720 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  28.15 
 
 		 672 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  28.75 
 
 		 611 aa  251  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  28.53 
 
 		 651 aa  251  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  29.03 
 
 		 658 aa  242  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  25.43 
 
 		 614 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.55 
 
 		 651 aa  196  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.82 
 
 		 656 aa  184  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.89 
 
 		 565 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.22 
 
 		 1433 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  23.75 
 
 		 1526 aa  79.7  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  23.97 
 
 		 1593 aa  75.1  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  22.82 
 
 		 1537 aa  74.3  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.65 
 
 		 741 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  29.36 
 
 		 757 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.65 
 
 		 740 aa  55.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.24 
 
 		 759 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.34 
 
 		 797 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.34 
 
 		 776 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  28.4 
 
 		 675 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.34 
 
 		 776 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  28.34 
 
 		 770 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.34 
 
 		 770 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  28.57 
 
 		 758 aa  52.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.71 
 
 		 740 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.32 
 
 		 723 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.71 
 
 		 740 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  28.71 
 
 		 740 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.71 
 
 		 740 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.24 
 
 		 757 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  29.02 
 
 		 740 aa  48.5  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  30.56 
 
 		 734 aa  44.3  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.55 
 
 		 725 aa  43.9  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>