168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4829 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4829  mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 417 aa  848    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0117  MscS mechanosensitive ion channel  45.1 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0117  MscS mechanosensitive ion channel  44.36 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0112  MscS mechanosensitive ion channel  44.36 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0121  MscS Mechanosensitive ion channel  45.1 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4237  MscS mechanosensitive ion channel  45.1 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3752  MscS mechanosensitive ion channel  45.1 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0117  MscS mechanosensitive ion channel  45.1 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0122  MscS mechanosensitive ion channel  45.1 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0118  MscS mechanosensitive ion channel  44.36 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0327583  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4442  MscS mechanosensitive ion channel  44.85 
 
 		 420 aa  359  5e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0086  MscS mechanosensitive ion channel  43.21 
 
 		 426 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.845728  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3632  putative small-conductance mechanosensitive channel  45.19 
 
 		 393 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0121  small-conductance mechanosensitive channel  44.09 
 
 		 392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4834  MscS mechanosensitive ion channel  43.14 
 
 		 421 aa  352  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2643  hypothetical protein  42.75 
 
 		 412 aa  345  8e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1014  MscS Mechanosensitive ion channel  44.84 
 
 		 424 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4158  MscS mechanosensitive ion channel  43.38 
 
 		 419 aa  344  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3295  MscS Mechanosensitive ion channel  46.81 
 
 		 424 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  43.85 
 
 		 476 aa  332  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3951  MscS mechanosensitive ion channel  41.91 
 
 		 422 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0018  MscS mechanosensitive ion channel  41.86 
 
 		 416 aa  328  8e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1641  MscS mechanosensitive ion channel  46.25 
 
 		 414 aa  328  9e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1729  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  46.25 
 
 		 414 aa  328  9e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.454596  hitchhiker  0.0000587449 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0968  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  49.53 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457255  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1534  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  46.25 
 
 		 414 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00538  predicted mechanosensitive channel  44.27 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3052  MscS Mechanosensitive ion channel  44.27 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3069  MscS mechanosensitive ion channel  44.27 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.588458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0658  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  44.27 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0624  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  44.27 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248163  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0471  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  44.27 
 
 		 415 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  44.27 
 
 		 415 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.734376  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1048  MscS mechanosensitive ion channel  44.66 
 
 		 421 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.23131 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  43.75 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0621  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  42.96 
 
 		 415 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0736  transporter small conductance mechanosensitive ion channel  42.96 
 
 		 415 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4057  MscS mechanosensitive ion channel  45.09 
 
 		 414 aa  322  8e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1064  MscS mechanosensitive ion channel  42.48 
 
 		 414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0670  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  42.72 
 
 		 415 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.74208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0680  small conductance mechanosensitive ion channel family transporter  42.72 
 
 		 415 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1267  MscS mechanosensitive ion channel  44.41 
 
 		 416 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0614  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel  42.72 
 
 		 415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010577  XfasM23_1733  MscS mechanosensitive ion channel  40.31 
 
 		 444 aa  319  5e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010513  Xfasm12_1801  hypothetical protein  40.05 
 
 		 444 aa  318  7.999999999999999e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  40.97 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2763  MscS mechanosensitive ion channel  40.3 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0634  hypothetical protein  39.32 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1692  MscS Mechanosensitive ion channel  40.97 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105564 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  40.05 
 
 		 442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4004  MscS mechanosensitive ion channel  44.69 
 
 		 453 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2264  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4466  MscS mechanosensitive ion channel  44.13 
 
 		 413 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4067  MscS mechanosensitive ion channel  43.58 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5728  MscS mechanosensitive ion channel  42.9 
 
 		 413 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4577  MscS mechanosensitive ion channel  42.9 
 
 		 413 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0774  MscS Mechanosensitive ion channel  38.94 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_3791  MscS mechanosensitive ion channel  42.9 
 
 		 464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4040  MscS mechanosensitive ion channel  41.49 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4533  MscS mechanosensitive ion channel  41.75 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0882  MscS mechanosensitive ion channel  41.09 
 
 		 420 aa  300  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1377  MscS mechanosensitive ion channel  41.49 
 
 		 433 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  39.19 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1436  MscS mechanosensitive ion channel  43.66 
 
 		 432 aa  296  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1739  MscS mechanosensitive ion channel  40.31 
 
 		 395 aa  295  9e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3919  MscS mechanosensitive ion channel  38.83 
 
 		 426 aa  295  9e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3828  MscS mechanosensitive ion channel  43.75 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280894  normal  0.277572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3267  MscS Mechanosensitive ion channel  38.58 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1574  mechanosensitive ion channel family protein  43.34 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1305  MscS mechanosensitive ion channel  43.02 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02197  hypothetical protein  37.2 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0330  MscS Mechanosensitive ion channel  43.24 
 
 		 423 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1821  MscS mechanosensitive ion channel  40.72 
 
 		 447 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.626552  decreased coverage  0.00243652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3803  MscS mechanosensitive ion channel  42.33 
 
 		 430 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1801  MscS mechanosensitive ion channel  36.92 
 
 		 437 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1659  hypothetical protein  42.6 
 
 		 442 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372862  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2323  mechanosensitive ion channel family protein  39.85 
 
 		 406 aa  285  7e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19230  hypothetical protein  42.49 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0321  MscS mechanosensitive ion channel  46.34 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.870771  normal  0.0509238 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10263  putative transmembrane transport protein  36.63 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.109786  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2846  MscS mechanosensitive ion channel  35.4 
 
 		 419 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6004  MscS mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6222  MscS Mechanosensitive ion channel  31.94 
 
 		 404 aa  233  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1331  MscS mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 541 aa  137  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.434406  hitchhiker  0.00000000000183262 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  26.75 
 
 		 624 aa  62  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1650  MscS mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 570 aa  59.7  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  22.08 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4521  MscS Mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  19.03 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  23.53 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  23.45 
 
 		 682 aa  56.2  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  24.24 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
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NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  30.06 
 
 		 648 aa  53.9  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal  1 
 
 
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NC_007484  Noc_1914  MscS mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 275 aa  53.5  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  23.88 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  25.98 
 
 		 849 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
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NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  29.48 
 
 		 650 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371389 
 
 
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NC_013440  Hoch_4500  MscS Mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 662 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  21.29 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal  1 
 
 
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NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  27.39 
 
 		 627 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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