More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1067 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 341 aa  687    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.82 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.5 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  26.01 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  27.22 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  24.93 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 257 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  22.8 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  29.35 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.17 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  24.1 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  21.25 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  27.17 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  22.06 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  20.9 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  20.9 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  20.9 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  20.9 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  21.35 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  20.62 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  20.23 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 		 366 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  26.53 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  21.2 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.7 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  25.23 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  22.15 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  20.77 
 
 		 369 aa  67  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  20.62 
 
 		 373 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  20.34 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  26.18 
 
 		 260 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  26.7 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  20.34 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  25.44 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  19.66 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  25.11 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  19.41 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  22.97 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  31.74 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  22.55 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  21.64 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  21.64 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  21.69 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  22.75 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  18.55 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  19.9 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  23.83 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  19.57 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.44 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  20.17 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  21.43 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  24.42 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  20.96 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  22.27 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  21.32 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  20.96 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  19.46 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.56 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  22.84 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  21.6 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  21.31 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  20.23 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.4 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  24.61 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 247 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  21.66 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  18.89 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  24.34 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  23.35 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>