More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL05010 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL05010  GabA permease, putative  100 
 
 		 518 aa  1047    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01061  GABA transporter (Eurofung)  60.28 
 
 		 530 aa  583  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0276029  normal  0.0879466 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_16647  predicted protein  42.51 
 
 		 537 aa  395  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0247353  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08990  GABA transporter, putative (Eurofung)  41.14 
 
 		 542 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00206587  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06000  GabA permease, putative  37 
 
 		 547 aa  325  1e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.423661  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41725  predicted protein  30.95 
 
 		 571 aa  263  8e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.817066  hitchhiker  0.00692909 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07392  choline transporter, putative (Eurofung)  32.21 
 
 		 495 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01030  choline transporter, putative  31.93 
 
 		 576 aa  252  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7231  amino acid permease-associated region  34.14 
 
 		 514 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04124  GABA transporter, putative (Eurofung)  36.59 
 
 		 442 aa  243  6e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475155 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02962  GABA permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y860]  34 
 
 		 520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533637  normal  0.42744 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3296  hypothetical protein  32.71 
 
 		 519 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.171098 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07150  GABA transporter, putative (Eurofung)  31.85 
 
 		 532 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1853  amino acid permease-associated region  33.27 
 
 		 528 aa  219  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.133441  normal  0.907353 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06480  hypothetical protein  28.22 
 
 		 526 aa  219  8.999999999999998e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.559132  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30629  predicted protein  30.36 
 
 		 526 aa  215  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.555507  normal  0.773072 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08726  GABA transporter (Eurofung)  32.02 
 
 		 514 aa  213  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.538203 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41155  predicted protein  31.24 
 
 		 539 aa  209  7e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.745721  normal  0.0472974 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03345  GABA transporter, putative (Eurofung)  30.13 
 
 		 532 aa  203  7e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505774  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09441  choline transporter (Eurofung)  28.96 
 
 		 542 aa  197  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03347  GABA transporter, putative (Eurofung)  31.72 
 
 		 527 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5923  amino acid permease-associated region  30.42 
 
 		 514 aa  193  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.123062 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00856  choline transporter (Eurofung)  27.42 
 
 		 518 aa  193  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15169  normal  0.238191 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05275  choline transporter, putative (Eurofung)  29.98 
 
 		 516 aa  193  7e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0796  amino acid permease family protein  29.3 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10972  choline transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15150)  28.8 
 
 		 516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.815116 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05968  amino acid transporter (Eurofung)  26.47 
 
 		 570 aa  189  9e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10905  GABA permease (Uga4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03370)  28.16 
 
 		 544 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2589  amino acid permease-associated region  30.25 
 
 		 527 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.729584  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02287  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.93 
 
 		 553 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52700  GABA/polyamine transporter  27 
 
 		 538 aa  171  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113876 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39042  GABA-specific high-affinity permease  25.98 
 
 		 570 aa  167  5.9999999999999996e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02043  GABA transporter, putative (Eurofung)  27.59 
 
 		 507 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2651  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 		 496 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03081  amino acid transporter (Eurofung)  24.51 
 
 		 502 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.276198  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07958  GABA transporter, putative (Eurofung)  25.34 
 
 		 499 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0588823  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2131  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.702859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2277  amino acid permease-associated region  26.19 
 
 		 522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308026 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64090  predicted protein  26.57 
 
 		 547 aa  130  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.111826  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3605  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 539 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3537  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 499 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.433323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3532  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 499 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.36606  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03304  GABA transporter, putative (Eurofung)  29.28 
 
 		 517 aa  130  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215456  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3364  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5201  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165021  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3928  amino acid permease-associated region  28.89 
 
 		 492 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2753  amino acid transporter  26.22 
 
 		 510 aa  128  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1845  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 505 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7845  Amino acid transporter-like protein  25.55 
 
 		 527 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1845  amino acid permease-associated region  27.71 
 
 		 522 aa  123  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.689083  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2894  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2634  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0482773  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00330  gamma-aminobutyric acid transporter, putative  27.42 
 
 		 496 aa  118  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0814592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2391  amino acid permease-associated region  26.12 
 
 		 516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2946  Amino acid permease protein  25.48 
 
 		 523 aa  106  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3084  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150726  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2292  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05590  amino acid/metabolite permease, putative  23.24 
 
 		 764 aa  99  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1043  amino acid permease-associated region  22.89 
 
 		 494 aa  99  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490599 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2300  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.83831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2253  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217736  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08198  choline transporter, putative (Eurofung)  27.14 
 
 		 509 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.273035  normal  0.278378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2500  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 521 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0303184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2508  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 521 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.522988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2463  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 		 521 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143129  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01702  conserved hypothetical protein  30.54 
 
 		 391 aa  91.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0232307  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3688  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 		 538 aa  90.5  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2000  amino acid permease-associated region  22.48 
 
 		 547 aa  90.9  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1591  permease, urea carboxylase system  23.76 
 
 		 513 aa  90.9  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.457317  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1734  amino acid permease-associated region  22.65 
 
 		 506 aa  90.1  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3891  permease, urea carboxylase system  25.43 
 
 		 519 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3725  amino acid permease-associated region  25.09 
 
 		 549 aa  87  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.747367  normal  0.414333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3724  amino acid permease-associated region  23.35 
 
 		 562 aa  84.3  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3666  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3846  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 497 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  24.55 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  25.62 
 
 		 725 aa  70.9  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4517  amino acid permease-associated region  20.84 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844231  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  22.09 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  23.54 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0800  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  27.47 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  23.32 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 716 aa  60.5  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  23.04 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4043  amino acid permease-associated region  22.85 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0901  amino acid permease-associated region  24.53 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  24.21 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.17 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  22.8 
 
 		 473 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.31 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  23.38 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  23.94 
 
 		 472 aa  57  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 770 aa  56.6  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  25.58 
 
 		 446 aa  57  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>