More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1463 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1463  general secretory pathway protein F  100 
 
 
392 aa  774    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1643  general secretory pathway protein F  98.98 
 
 
393 aa  769    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.209912  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1816  general secretory pathway protein F  97.96 
 
 
392 aa  760    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1051  type II secretion system protein  30.66 
 
 
413 aa  218  1e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1232  transcription regulator AsnC  29.51 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0393  putative type II protein secretion system F protein CtsF  40.36 
 
 
321 aa  206  4e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1011  type II secretion system protein  30.46 
 
 
413 aa  205  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1963  type II secretion system protein  28.57 
 
 
415 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1040  Type II secretion system F domain protein  28.22 
 
 
413 aa  184  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  26.6 
 
 
405 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  30.14 
 
 
411 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1388  type II secretion system protein  26.38 
 
 
414 aa  160  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  28.78 
 
 
407 aa  155  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  25.26 
 
 
406 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  22.89 
 
 
406 aa  150  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  28.49 
 
 
407 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  25.64 
 
 
404 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  26.78 
 
 
407 aa  149  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  27.41 
 
 
408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  23.37 
 
 
409 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  26.57 
 
 
405 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  22.44 
 
 
407 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  25.58 
 
 
406 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  25.76 
 
 
405 aa  142  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  25.45 
 
 
401 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  24.18 
 
 
406 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  25.07 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  25.07 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  25.07 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  25.61 
 
 
408 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  24.78 
 
 
406 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18690  type II secretion system protein  26.47 
 
 
410 aa  135  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  23.6 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  25.88 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  24.85 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  22.25 
 
 
401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  25 
 
 
406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  24.78 
 
 
406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  22.5 
 
 
401 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  24.92 
 
 
406 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  24.78 
 
 
406 aa  133  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  24.78 
 
 
406 aa  133  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1134  type II secretion system protein  23 
 
 
401 aa  133  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  24.44 
 
 
412 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  24.93 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1685  type II secretory pathway, component PulF  24.93 
 
 
402 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381238  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  24.62 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  22.69 
 
 
408 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  23.95 
 
 
405 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  23.82 
 
 
407 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4572  MSHA biogenesis protein MshG  25.19 
 
 
408 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  23.87 
 
 
408 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  22.41 
 
 
405 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  23.32 
 
 
401 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  21.93 
 
 
419 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  22.77 
 
 
406 aa  123  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0457  protein transport protein  26.99 
 
 
406 aa  124  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  22.05 
 
 
409 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  23.62 
 
 
404 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  24.88 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0252  general secretion pathway protein F  22.54 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  21.28 
 
 
402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  21.39 
 
 
405 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  26.49 
 
 
404 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  26.49 
 
 
404 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  25.39 
 
 
403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  23.93 
 
 
422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  24.55 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0770  type II secretion system protein  24.56 
 
 
405 aa  120  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  21.39 
 
 
419 aa  119  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  22.71 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0857  general secretory pathway protein F  24.56 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  22.74 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  19.84 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  24.25 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  23.27 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2175  type II secretion system protein  20.22 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357882  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  23.99 
 
 
409 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  23.1 
 
 
406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28630  Type II secretion system protein F  24.5 
 
 
396 aa  116  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  22.62 
 
 
419 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1087  type II secretion system protein  22.25 
 
 
419 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0972  type IV pilus biogenesis protein PilC  22.25 
 
 
419 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.910627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  21.28 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3554  type II secretion system protein  22.37 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1749  type II secretion system protein  24.21 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.28453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  21.59 
 
 
405 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  26.01 
 
 
410 aa  114  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  22.59 
 
 
403 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1314  type II secretory pathway protein LspF  24.26 
 
 
399 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3150  type II secretion system protein  22 
 
 
400 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  22.86 
 
 
422 aa  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3372  type IV pilin biogenesis protein  20.73 
 
 
399 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3316  general secretion pathway protein F  22.19 
 
 
400 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233572  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  22.06 
 
 
419 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1317  type II secretory pathway protein LspF  24.26 
 
 
399 aa  112  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  20.81 
 
 
463 aa  112  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  20.41 
 
 
463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  24.5 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  23.02 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>