More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0902 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1190  30S ribosomal protein S1  73.17 
 
 		 517 aa  764    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0972  30S ribosomal protein S1  98.92 
 
 		 556 aa  1082    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.577662  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0613  RNA binding S1 domain protein  63.49 
 
 		 558 aa  723    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000620529  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0481  30S ribosomal protein S1  68.07 
 
 		 557 aa  744    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0920  30S ribosomal protein S1  96.22 
 
 		 556 aa  1035    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1567  30S ribosomal protein S1  67.5 
 
 		 558 aa  724    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0902  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 556 aa  1094    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0514  30S ribosomal protein S1  67.99 
 
 		 557 aa  725    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1250  30S ribosomal protein S1  68.22 
 
 		 557 aa  771    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0873  30S ribosomal protein S1  56.77 
 
 		 551 aa  593  1e-168  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0435842  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  33.21 
 
 		 560 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  32.09 
 
 		 584 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  33.1 
 
 		 573 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  31.91 
 
 		 584 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1967  30S ribosomal protein S1  33.39 
 
 		 559 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23330  30S ribosomal protein S1  33.39 
 
 		 559 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000169607  hitchhiker  0.00388994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15870  30S ribosomal protein S1  33.51 
 
 		 559 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  34.75 
 
 		 559 aa  306  6e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  32.79 
 
 		 556 aa  306  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  32.82 
 
 		 609 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  33.98 
 
 		 574 aa  302  9e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  33.82 
 
 		 553 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1854  30S ribosomal protein S1  33.15 
 
 		 560 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  35.05 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  32.5 
 
 		 579 aa  301  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  33.7 
 
 		 557 aa  300  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  33.75 
 
 		 571 aa  299  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  32.31 
 
 		 584 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  33.81 
 
 		 559 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  32.73 
 
 		 569 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1494  30S ribosomal protein S1  34.62 
 
 		 563 aa  297  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805481  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  33.09 
 
 		 570 aa  297  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  32.4 
 
 		 596 aa  297  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  32.55 
 
 		 569 aa  296  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1772  30S ribosomal protein S1  32.32 
 
 		 558 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3942  30S ribosomal protein S1  32.32 
 
 		 558 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.121339  normal  0.203067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  32.66 
 
 		 586 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1673  30S ribosomal protein S1  34.45 
 
 		 563 aa  296  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000046796  normal  0.385935 
 
 
 
NC_010501  PputW619_1379  30S ribosomal protein S1  32.32 
 
 		 558 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1363  30S ribosomal protein S1  32.32 
 
 		 558 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0329116  normal  0.0187285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  31.33 
 
 		 575 aa  294  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4072  30S ribosomal protein S1  33.64 
 
 		 561 aa  293  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000537264  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1597  30S ribosomal protein S1  31.89 
 
 		 558 aa  290  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1540  30S ribosomal protein S1  31.89 
 
 		 558 aa  290  3e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  32.36 
 
 		 570 aa  291  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02120  30S ribosomal subunit protein S1  36.42 
 
 		 504 aa  290  5.0000000000000004e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000618962  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2855  30S ribosomal protein S1  33.46 
 
 		 560 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000740795  hitchhiker  0.0000000202949 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 		 556 aa  290  6e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1750  ribosomal protein S1  32.44 
 
 		 563 aa  290  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00710774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3642  30S ribosomal protein S1  32.44 
 
 		 563 aa  290  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0546866  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  32.19 
 
 		 555 aa  289  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  34 
 
 		 555 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  34 
 
 		 555 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  34 
 
 		 555 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  33.04 
 
 		 560 aa  289  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  33.21 
 
 		 569 aa  289  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  33.21 
 
 		 569 aa  289  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  34 
 
 		 555 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  31.26 
 
 		 577 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  32.18 
 
 		 570 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  32.18 
 
 		 570 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  32.39 
 
 		 593 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  31.12 
 
 		 561 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  30.93 
 
 		 577 aa  286  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2145  ribosomal protein S1  31.96 
 
 		 573 aa  286  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000142665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  32.73 
 
 		 556 aa  286  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  31.78 
 
 		 558 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 		 555 aa  286  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  33.15 
 
 		 555 aa  286  9e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 		 555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2298  30S ribosomal protein S1  32.77 
 
 		 555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000879863  unclonable  0.000000000196055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 		 555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 		 555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  33.63 
 
 		 555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 		 555 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  33.71 
 
 		 555 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  32.73 
 
 		 556 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  30.39 
 
 		 604 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  31.44 
 
 		 567 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  31.77 
 
 		 565 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1646  30S ribosomal protein S1  31.42 
 
 		 561 aa  284  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563909  normal  0.099465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  31.77 
 
 		 565 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1709  30S ribosomal protein S1  33.89 
 
 		 559 aa  283  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000421469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 557 aa  283  7.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  32.91 
 
 		 555 aa  282  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00891  30S ribosomal protein S1  31.29 
 
 		 561 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0317797  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1014  30S ribosomal protein S1  34.14 
 
 		 557 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1046  30S ribosomal protein S1  34.14 
 
 		 557 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  31.64 
 
 		 567 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2311  30S ribosomal protein S1  34.1 
 
 		 555 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000015623  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1079  30S ribosomal protein S1  34.14 
 
 		 557 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0828489 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1430  30S ribosomal protein S1  33.95 
 
 		 557 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00086358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0987  30S ribosomal protein S1  34.14 
 
 		 557 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0123742  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1094  30S ribosomal protein S1  34.14 
 
 		 557 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.613662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2237  30S ribosomal protein S1  33.7 
 
 		 557 aa  281  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000585516  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  31.77 
 
 		 565 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0180  30S ribosomal protein S1  32.55 
 
 		 561 aa  280  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000762655  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  30.96 
 
 		 557 aa  280  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  32.44 
 
 		 569 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  31.89 
 
 		 570 aa  280  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>