59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3302 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3302  surface antigen  100 
 
 		 756 aa  1541    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.939122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5163  two component regulator propeller domain protein  30.15 
 
 		 774 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.522129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0461  two component regulator propeller domain protein  28.91 
 
 		 765 aa  270  8.999999999999999e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0707  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  26.52 
 
 		 760 aa  233  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02505  immunoreactive 84 kDa antigen  25.2 
 
 		 761 aa  196  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4547  hypothetical protein  36.6 
 
 		 608 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1929  two component regulator propeller domain protein  23.28 
 
 		 775 aa  174  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00113538  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1604  immunoreactive 84 kDa antigen PG93  23.65 
 
 		 776 aa  168  4e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  25.45 
 
 		 1397 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  26.14 
 
 		 1366 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  27.41 
 
 		 1340 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.72 
 
 		 1276 aa  58.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  28.18 
 
 		 1378 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  24.12 
 
 		 1021 aa  57.4  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 1226 aa  57.4  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  25.26 
 
 		 692 aa  55.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  25.56 
 
 		 1374 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  23.35 
 
 		 1093 aa  53.9  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  25.1 
 
 		 1374 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 1258 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  20.85 
 
 		 1105 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  21.51 
 
 		 1114 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  24.69 
 
 		 1194 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  24.9 
 
 		 1355 aa  51.6  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  32.22 
 
 		 1418 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.03 
 
 		 1079 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  22.73 
 
 		 1407 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  21.43 
 
 		 1414 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  20.64 
 
 		 1017 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  25.43 
 
 		 1306 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  21.58 
 
 		 1498 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  22.02 
 
 		 1086 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  24.83 
 
 		 1400 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.1 
 
 		 1242 aa  49.7  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  22.03 
 
 		 1250 aa  50.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  24.32 
 
 		 1404 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  25.75 
 
 		 1370 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  24.56 
 
 		 987 aa  48.9  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  29.89 
 
 		 1378 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  25.37 
 
 		 1278 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  26.62 
 
 		 1388 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  25.34 
 
 		 1334 aa  47.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  24.32 
 
 		 1278 aa  47.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  27.08 
 
 		 1346 aa  47.8  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  23.74 
 
 		 695 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  24.35 
 
 		 1118 aa  47  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.4 
 
 		 1505 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 		 1237 aa  46.6  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  27.42 
 
 		 985 aa  45.8  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  27.06 
 
 		 1034 aa  45.8  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  27.06 
 
 		 1335 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  29.46 
 
 		 1070 aa  45.8  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  25.43 
 
 		 1363 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  25 
 
 		 1324 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  22.86 
 
 		 1008 aa  44.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  25.42 
 
 		 1526 aa  44.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  27.32 
 
 		 534 aa  44.3  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  33.33 
 
 		 1344 aa  44.3  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  27.01 
 
 		 1053 aa  44.3  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>