More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0104 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  100 
 
 		 134 aa  270  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  37.7 
 
 		 137 aa  89.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  36.15 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  37.9 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  37.3 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  36.29 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  31.85 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  35 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  34.88 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  33.08 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  30.4 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  35.09 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  29.27 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  30.47 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  34.21 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  30.71 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  26.45 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  26.23 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  35.66 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  35.29 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  32.48 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  32.54 
 
 		 320 aa  63.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0147  response regulator receiver protein  25.4 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3604  response regulator receiver  36.67 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  26.23 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0130  response regulator receiver protein  25.4 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  26.98 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  28.68 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  28.24 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  25.21 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0891  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  30.51 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2095  response regulator receiver protein  26.96 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  26.72 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 202 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  27.05 
 
 		 539 aa  60.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  28.24 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3951  response regulator  33.33 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  24.24 
 
 		 531 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  25.21 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  27.91 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  25.19 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  24.43 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  26.89 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  25.41 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  27.64 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  27.56 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  27.5 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  29.06 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  25 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1417  two component Fis family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 492 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2574  response regulator  30.89 
 
 		 368 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  29.13 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  25.78 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  24.39 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  24.81 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>