More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0914 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  435  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0740  hypothetical protein  64.15 
 
 
212 aa  268  2.9999999999999997e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  51.39 
 
 
214 aa  224  5.0000000000000005e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50.93 
 
 
212 aa  218  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  51.63 
 
 
217 aa  217  1e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  50.48 
 
 
216 aa  215  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  50.23 
 
 
213 aa  200  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  50.23 
 
 
213 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  50.23 
 
 
213 aa  197  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  45.67 
 
 
212 aa  194  9e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  37.76 
 
 
225 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.24 
 
 
225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.76 
 
 
225 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  30.73 
 
 
219 aa  96.7  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.15 
 
 
230 aa  94  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.09 
 
 
212 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  33.68 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  34.59 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  32.47 
 
 
234 aa  91.7  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  32.39 
 
 
252 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  32.31 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  33.87 
 
 
214 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 
252 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 
252 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  34.04 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  32.41 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 
252 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  33.33 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 
252 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.9 
 
 
206 aa  89.4  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  31.17 
 
 
252 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  32.47 
 
 
234 aa  88.6  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  31.17 
 
 
252 aa  88.6  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  31.17 
 
 
252 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.17 
 
 
252 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.17 
 
 
252 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 
232 aa  87.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  31.17 
 
 
252 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  31.17 
 
 
252 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  31.17 
 
 
252 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.5 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  31.17 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.85 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  31.44 
 
 
232 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  31.44 
 
 
232 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  31.44 
 
 
232 aa  87  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  32.64 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  29.65 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 
233 aa  85.5  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  29.6 
 
 
235 aa  85.5  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.27 
 
 
296 aa  84.7  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 
232 aa  84.7  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
227 aa  84  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  29.59 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  27.05 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  31.34 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  30.26 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  27.23 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  30.21 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.23 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.69 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  30.19 
 
 
253 aa  81.6  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  30.26 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  28.28 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  32.99 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  30.57 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  28.02 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  30.61 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  29.19 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  29.59 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  29.56 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  30.54 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  32.31 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  30.09 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  29.74 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  31.07 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  28.21 
 
 
233 aa  79  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
227 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  29.9 
 
 
231 aa  79  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  30.46 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.8 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  29.08 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.04 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  29.08 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.72 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  28.29 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  31.07 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  30.61 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.9 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  30.98 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  28.06 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>