211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12528 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12528  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  489  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4717  LmbE family protein  69.33 
 
 		 238 aa  357  7e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0232  LmbE family protein  69.62 
 
 		 238 aa  351  7e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.894745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1208  LmbE family protein  56.12 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0084  LmbE family protein  58.72 
 
 		 242 aa  274  9e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1776  hypothetical protein  54.17 
 
 		 243 aa  272  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0204994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0661  LmbE family protein  52.3 
 
 		 239 aa  270  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.152774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3083  LmbE family protein  51.46 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.0323718 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  42.86 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  42.31 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0824  LmbE family protein  44.12 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000104846  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  44.59 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0942  LmbE family protein  40.34 
 
 		 270 aa  188  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1419  hypothetical protein  42.61 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0672  LmbE family protein  44.93 
 
 		 266 aa  184  8e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  42.01 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  39.41 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  42.54 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  38.14 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  38.98 
 
 		 234 aa  158  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  38.14 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  38.14 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  38.14 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  38.14 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  38.14 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  38.14 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  38.77 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  38.77 
 
 		 234 aa  154  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  38.82 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  36.91 
 
 		 251 aa  141  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0497  LmbE family protein  38.03 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  34.73 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  34.35 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2813  LmbE family protein  36.84 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  32.34 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2396  LmbE family protein  36.51 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.629965  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0446  LmbE family protein  32.97 
 
 		 221 aa  93.6  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1698  LmbE family protein  30.52 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.958754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  30.74 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0922  LmbE family protein  28.38 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  30.04 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  31.75 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  27.98 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  29.21 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  30.13 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0634  LmbE family protein  29.07 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0198717  normal  0.0139118 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  29.23 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  28.93 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1217  LmbE family protein  30.89 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  27.84 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  30.32 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  29.05 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  29.34 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  29.23 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0837  LmbE family protein  27.35 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1608  LmbE family protein  30.37 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  30.57 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  30.57 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  30.57 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  28.95 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0048  LmbE family protein  27.27 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3950  LmbE family protein  28.98 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1152  LmbE family protein  28.95 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.370679  normal  0.107811 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1056  LmbE family protein  28.93 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3436  LmbE family protein  30.37 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550746  normal  0.108927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5532  LmbE family protein  29.47 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674853  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1971  LmbE-like protein protein  27.95 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2607  LmbE family protein  27.23 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0084  hypothetical protein  27.88 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2249  LmbE family protein  27.37 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.909086  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2570  LmbE family protein  25.68 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1745  LmbE family protein  27.85 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.785028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  26.92 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3730  LmbE family protein  27.27 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0416  LmbE family protein  26.69 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1337  LmbE family protein  27.32 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  24.5 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3624  LmbE family protein  29.34 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  29.11 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10120  uncharacterized LmbE-like protein  28.36 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.427532  normal  0.625188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2604  LmbE family protein  27.46 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1525  LmbE family protein  31.12 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75357  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.69 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.69 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  28.69 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  28.69 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4793  response regulator receiver protein  28.49 
 
 		 350 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  27.89 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  31.98 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2080  LmbE family protein  32.2 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0263313  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  35.78 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4797  LmbE family protein  27.27 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.861098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4038  conserved hypothetical protein LmbE  27.94 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3452  LmbE family protein  27.14 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1395  LmbE family protein  27.5 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.067563  normal  0.604637 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1324  LmbE-like protein  28.27 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0060113  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  27.32 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  27.9 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  29.08 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>