More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1396 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
174 aa  342  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  92.53 
 
 
174 aa  317  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  56.38 
 
 
167 aa  179  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  53.1 
 
 
165 aa  164  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  54.61 
 
 
175 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 
179 aa  156  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  53.42 
 
 
186 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  47.97 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 
153 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
151 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
151 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 
155 aa  94.4  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 
143 aa  93.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 
158 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 
167 aa  88.2  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
182 aa  87  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  35.17 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 
147 aa  84.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
152 aa  84.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.17 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.67 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  34.42 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  33.81 
 
 
144 aa  80.5  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  33.56 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  34.11 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  32.03 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
156 aa  79  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  35.85 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0740  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0920  AsnC family transcriptional regulator  35.03 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.681617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  34.97 
 
 
148 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
174 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0680  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4452  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00957893  normal  0.739867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0883  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0448887  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  32.9 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1100  leucine-responsive regulatory protein, putative  32.91 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  32.62 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0739  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0726  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0994  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  34.88 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7459  transcriptional regulator  34.44 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  41.55 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0925  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.69749e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  37.01 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  37.01 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  29.2 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  40.48 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.5 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0580  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015391  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  31.25 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  39.68 
 
 
158 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3597  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 
173 aa  72  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.680866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>