236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6747 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  100 
 
 		 313 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  28.94 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  28.94 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  28.94 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1285  Auxin Efflux Carrier  28.94 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1297  putative transporter YfdV  28.94 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2741  putative transporter YfdV  28.94 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3604  putative transporter YfdV  28.94 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.290153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2522  putative transporter YfdV  28.94 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2659  putative transporter YfdV  28.94 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1706  Auxin Efflux Carrier  30.35 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1593  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1764  permease  27.91 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  27.85 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  28.39 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  27.76 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  30.06 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3774  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  28.76 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  27.71 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  27.71 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  25.82 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  27.78 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25.75 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  28.76 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  26.85 
 
 		 314 aa  85.9  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.27 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  28.76 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  29.03 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.73 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  26.06 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  25 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  27.96 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  24.1 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  30.94 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.94 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.76 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  25.72 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  26.91 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.73 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  26.47 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.16 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  25.67 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  26.37 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  23.65 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  28.01 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  24.34 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  26.1 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0249  permease  33.33 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0415605 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  27.91 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  26.53 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  26.64 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  24.76 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  23 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  23.78 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  26.44 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  25.42 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  26.73 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  25.51 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.02 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.02 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.02 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  29.84 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  24.37 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  23.9 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  23.95 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  21.86 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  24.36 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  27.13 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  25.69 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  25.77 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  23.61 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  26.53 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  26.58 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  32.48 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  21.93 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  31.85 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  31.85 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  25.25 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  25.57 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  32.48 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  23.61 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  23.61 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  31.21 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  32.48 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  25.08 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  31.85 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  23.86 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>