More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6037 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.53 
 
 
417 aa  749    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3471  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  88.01 
 
 
417 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
421 aa  843    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.356927  normal  0.017991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.37 
 
 
415 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0749  polyamine ABC transporter permease  49.27 
 
 
415 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5123  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.25 
 
 
415 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0230497  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07890  putative permease of ABC transporter  47.87 
 
 
415 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0564  polyamine ABC transporter, permease protein  48.1 
 
 
415 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003667  putative permease of ABC transporter  44 
 
 
426 aa  360  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4613  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.34 
 
 
415 aa  359  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.993847 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.82 
 
 
423 aa  359  7e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.45 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.966966 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.39 
 
 
423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229456  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.25 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0108621  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0447  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.63 
 
 
415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.328312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.63 
 
 
415 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155483  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2168  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  46.81 
 
 
418 aa  352  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0193763  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2931  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  46.6 
 
 
422 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.63 
 
 
415 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.382081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.24 
 
 
416 aa  348  8e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0426  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.03 
 
 
424 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.34 
 
 
420 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156739  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.75 
 
 
420 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.34 
 
 
420 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 
418 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 
418 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126385  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 
418 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.47 
 
 
418 aa  345  7e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.07 
 
 
422 aa  345  8.999999999999999e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.12 
 
 
425 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.653272  normal  0.230244 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.07 
 
 
422 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.275923  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.1 
 
 
424 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370122  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46 
 
 
462 aa  339  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105452 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.94 
 
 
422 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030853  normal  0.984041 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.59 
 
 
413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.55 
 
 
422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.633443  hitchhiker  0.0000000331128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 
423 aa  335  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2046  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.67 
 
 
406 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.480866  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.2 
 
 
420 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193876  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0433  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.84 
 
 
419 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2360  putative polyamine ABC transporter, permease protein  46.84 
 
 
419 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0813  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.84 
 
 
419 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0484  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.84 
 
 
419 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2499  putative polyamine ABC transporter, permease protein  46.84 
 
 
419 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1813  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.84 
 
 
419 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574113  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.3 
 
 
424 aa  329  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457285 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0644  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.12 
 
 
419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.62 
 
 
423 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1220  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  47.29 
 
 
421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.01 
 
 
421 aa  318  9e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.86 
 
 
424 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3108  spermidine/putrescine ABC transporter permease  47.01 
 
 
421 aa  317  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.48 
 
 
433 aa  316  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.48 
 
 
430 aa  315  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.42 
 
 
527 aa  312  5.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1732  transport system permease transmembrane protein  48.07 
 
 
420 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0286401  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1884  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  48.13 
 
 
424 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.343799  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0328  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  41.15 
 
 
412 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 
414 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
411 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
391 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4106  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.82 
 
 
389 aa  279  8e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.93 
 
 
541 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1612  spermidine/putrescine ABC transporter permease  41.19 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.47 
 
 
557 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.347255  normal  0.330105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
393 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0468  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
416 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.6 
 
 
597 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
301 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 
291 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.83 
 
 
288 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3242  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.89 
 
 
314 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1508  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  42.06 
 
 
301 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal  0.0460711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.2 
 
 
593 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
302 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
290 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
283 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
596 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 
290 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal  0.277874 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
294 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132934  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2666  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  41.45 
 
 
284 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2400  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.41 
 
 
318 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0272456  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
283 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783769  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 
283 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153195  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1589  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  46.15 
 
 
303 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0639141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0157506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
606 aa  166  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6090  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  40.4 
 
 
300 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467049  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
305 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.41 
 
 
298 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
587 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
305 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.192229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
305 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2210  ABC transporter, membrane spanning protein (polyamine)  41.85 
 
 
294 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0568314  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1106  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  41.85 
 
 
271 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
293 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.38 
 
 
591 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621124  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
285 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.844332  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
593 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.156031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>