More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0668 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.71 
 
 
424 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1884  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  91.71 
 
 
424 aa  652    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.343799  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
424 aa  848    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457285 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.79 
 
 
433 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.86 
 
 
430 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.93 
 
 
414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.63 
 
 
424 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370122  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003667  putative permease of ABC transporter  49.38 
 
 
426 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2046  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.94 
 
 
406 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.480866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.67 
 
 
417 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3471  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  46.06 
 
 
417 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2931  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  45.43 
 
 
422 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0749  polyamine ABC transporter permease  46.23 
 
 
415 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.77 
 
 
416 aa  342  8e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.89 
 
 
421 aa  342  8e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.356927  normal  0.017991 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 
446 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0108621  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.93 
 
 
541 aa  339  7e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07890  putative permease of ABC transporter  46.23 
 
 
415 aa  339  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567527 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.02 
 
 
557 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.347255  normal  0.330105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2168  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  45.61 
 
 
418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0193763  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.47 
 
 
425 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.653272  normal  0.230244 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.48 
 
 
423 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.51 
 
 
411 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.68 
 
 
418 aa  332  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.18 
 
 
418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.18 
 
 
418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126385  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.18 
 
 
418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0426  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.54 
 
 
424 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.97 
 
 
420 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156739  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.97 
 
 
420 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.85 
 
 
415 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 
462 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5123  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.28 
 
 
415 aa  322  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0230497  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0644  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.5 
 
 
419 aa  319  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2499  putative polyamine ABC transporter, permease protein  46.5 
 
 
419 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0564  polyamine ABC transporter, permease protein  43.07 
 
 
415 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4613  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.31 
 
 
415 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.993847 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.26 
 
 
423 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0433  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.25 
 
 
419 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0813  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.25 
 
 
419 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.37 
 
 
423 aa  317  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1813  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.25 
 
 
419 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574113  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0484  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.25 
 
 
419 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2360  putative polyamine ABC transporter, permease protein  46.25 
 
 
419 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.93 
 
 
415 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.966966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.25 
 
 
420 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.93 
 
 
415 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155483  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0447  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.69 
 
 
415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.328312 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.72 
 
 
413 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 
422 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
415 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.382081 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.47 
 
 
422 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.633443  hitchhiker  0.0000000331128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.68 
 
 
422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030853  normal  0.984041 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 
420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193876  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.34 
 
 
422 aa  307  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.275923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.85 
 
 
423 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1220  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  44.36 
 
 
421 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.1 
 
 
527 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.09 
 
 
421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0328  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  42.2 
 
 
412 aa  286  5e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3108  spermidine/putrescine ABC transporter permease  44.09 
 
 
421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1732  transport system permease transmembrane protein  43.37 
 
 
420 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0286401  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4106  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
389 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.95 
 
 
391 aa  257  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0468  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
416 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
393 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1612  spermidine/putrescine ABC transporter permease  38.04 
 
 
392 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1508  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  45.25 
 
 
301 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal  0.0460711 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 
294 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132934  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.8 
 
 
301 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3242  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.98 
 
 
314 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.52 
 
 
283 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.6 
 
 
290 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.39 
 
 
290 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal  0.277874 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
290 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 
291 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.39 
 
 
288 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
305 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0157506 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2210  ABC transporter, membrane spanning protein (polyamine)  47.11 
 
 
294 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0568314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2400  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.98 
 
 
318 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0272456  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
305 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  0.870065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2666  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  43.06 
 
 
284 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3815  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
305 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.192229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
305 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6090  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  41.74 
 
 
300 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467049  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.27 
 
 
298 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
597 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
593 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1106  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  43.43 
 
 
271 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04240  putative permease of ABC transporter  40.16 
 
 
309 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1533  polyamine transport protein PotB  39.04 
 
 
297 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.8542  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17630  polyamine transport protein PotB  39.04 
 
 
297 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
287 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716489  normal  0.098121 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
322 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3143  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.49 
 
 
305 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138017  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1589  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  46.15 
 
 
303 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0639141 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  38.21 
 
 
326 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
309 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
295 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>