More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6320 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
414 aa  820    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.93 
 
 
424 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.17 
 
 
424 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.08 
 
 
430 aa  435  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.14 
 
 
433 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1884  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  63.17 
 
 
424 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.343799  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003667  putative permease of ABC transporter  46.4 
 
 
426 aa  345  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.01 
 
 
417 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3471  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  44.42 
 
 
417 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.2 
 
 
424 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370122  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2046  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.54 
 
 
406 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.480866  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 
421 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.356927  normal  0.017991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.36 
 
 
541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.94 
 
 
411 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 
416 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.61 
 
 
557 aa  299  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.347255  normal  0.330105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0749  polyamine ABC transporter permease  42.21 
 
 
415 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
415 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07890  putative permease of ABC transporter  42.21 
 
 
415 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0564  polyamine ABC transporter, permease protein  41.77 
 
 
415 aa  289  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5123  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.49 
 
 
415 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0230497  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4613  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.77 
 
 
415 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.993847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
415 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.155483  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0447  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
415 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.328312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0426  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.61 
 
 
424 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
415 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.966966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.39 
 
 
446 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0108621  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
415 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.382081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2168  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  42.75 
 
 
418 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0193763  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.653272  normal  0.230244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2931  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  39.86 
 
 
422 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
420 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156739  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
420 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.14 
 
 
418 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.14 
 
 
418 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.14 
 
 
418 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126385  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.67 
 
 
418 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
423 aa  264  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.8 
 
 
422 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.275923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 
413 aa  264  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
462 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.105452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.73 
 
 
420 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193876  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0644  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  43.07 
 
 
419 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
422 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.633443  hitchhiker  0.0000000331128 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
422 aa  259  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 
422 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.030853  normal  0.984041 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
423 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229456  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2499  putative polyamine ABC transporter, permease protein  43.52 
 
 
419 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
423 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554758 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0433  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  43.28 
 
 
419 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0813  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  43.28 
 
 
419 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2360  putative polyamine ABC transporter, permease protein  43.28 
 
 
419 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0484  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  43.28 
 
 
419 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1813  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  43.28 
 
 
419 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574113  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0328  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  39.84 
 
 
412 aa  256  7e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
423 aa  255  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1220  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.89 
 
 
421 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1337  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.63 
 
 
421 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3108  spermidine/putrescine ABC transporter permease  42.63 
 
 
421 aa  249  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0468  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
416 aa  233  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.99 
 
 
527 aa  232  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1732  transport system permease transmembrane protein  42.17 
 
 
420 aa  229  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0286401  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
393 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4106  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.43 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1612  spermidine/putrescine ABC transporter permease  37.7 
 
 
392 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1508  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  43.44 
 
 
301 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0734046  normal  0.0460711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 
301 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.44 
 
 
302 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3242  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.55 
 
 
314 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04240  putative permease of ABC transporter  43.69 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
290 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
313 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.036296  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
294 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132934  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
597 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
283 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
593 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
296 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.248217 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
290 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal  0.277874 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1277  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0724  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  39.3 
 
 
326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0632  putrescine ABC transporter, permease protein PotH  39.3 
 
 
326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2018  putrescine ABC transport system, permease protein  39.3 
 
 
326 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2400  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.55 
 
 
318 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0272456  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 
326 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6248  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.89 
 
 
291 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
290 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
322 aa  153  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
324 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.93633  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0871  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  40.69 
 
 
284 aa  152  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17630  polyamine transport protein PotB  41.12 
 
 
297 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
295 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
309 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622  normal  0.150857 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6090  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  40.83 
 
 
300 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.467049  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
331 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
308 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
305 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0157506 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
308 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>